More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4189 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008765  Ajs_4189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
322 aa  660    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122889  hitchhiker  0.0000562905 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1400  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
644 aa  95.9  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.324076  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  28.78 
 
 
400 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  28.9 
 
 
383 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  31.28 
 
 
485 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.12 
 
 
466 aa  87  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  28.29 
 
 
270 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
447 aa  85.9  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.14 
 
 
598 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.67 
 
 
598 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  29.67 
 
 
598 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  29.67 
 
 
598 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.67 
 
 
598 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.67 
 
 
598 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.67 
 
 
598 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.67 
 
 
598 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  29.67 
 
 
598 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
485 aa  84  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  27.87 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  34.33 
 
 
380 aa  82.8  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2317  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.71 
 
 
598 aa  82.4  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
665 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
748 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  27.68 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
468 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0029863  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2407  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.48 
 
 
572 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3489  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.43 
 
 
560 aa  80.5  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0416624  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  29.53 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
671 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  26.97 
 
 
1739 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  32.45 
 
 
670 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  27.98 
 
 
515 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  30.77 
 
 
481 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2739  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.38 
 
 
566 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  33.19 
 
 
490 aa  79.7  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2846  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.38 
 
 
566 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2673  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.38 
 
 
566 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2624  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.38 
 
 
566 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2713  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  32.38 
 
 
566 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.774679 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
471 aa  79.3  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
478 aa  79.3  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1434  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
731 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.278277  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1557  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.16 
 
 
598 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1961  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.16 
 
 
598 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.68817 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1374  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.16 
 
 
613 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1897  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.16 
 
 
598 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.149462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2962  histidine kinase  25 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  30.56 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03848  Signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific  29.09 
 
 
588 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
989 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  30.56 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2712  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  28.5 
 
 
572 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  28.86 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  27.82 
 
 
459 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
446 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  30.56 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  30.56 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  30.56 
 
 
463 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  30.56 
 
 
463 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  31.96 
 
 
521 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 
775 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
468 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  30.24 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  31.31 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  33.81 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  29.96 
 
 
463 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
470 aa  77  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.510895  normal  0.956112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
470 aa  77  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
573 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
595 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
644 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  31.25 
 
 
461 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02360  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarP (NarL)  31.9 
 
 
566 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2748  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  31.9 
 
 
566 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.560652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1208  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  31.9 
 
 
566 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
594 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2615  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  31.9 
 
 
566 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.538567  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2598  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  31.9 
 
 
566 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
407 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3690  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  31.73 
 
 
566 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1902  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.81 
 
 
598 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02322  hypothetical protein  31.9 
 
 
566 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.147876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  27.07 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
472 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  26.73 
 
 
1093 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2838  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  31.73 
 
 
566 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2567  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.52 
 
 
623 aa  76.3  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
446 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
401 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
401 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  28.52 
 
 
461 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
401 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>