34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1187 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1187  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 167 aa  321  4e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.130785  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  38.66 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  34.51 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 351 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.04 
 
 		 153 aa  51.2  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.5 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  46.05 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 286 aa  48.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 322 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  30.57 
 
 		 343 aa  47.4  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  43.42 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2307  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.13 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  30.6 
 
 		 314 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 303 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1035  hypothetical protein  31.16 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 203 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 203 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 203 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.99 
 
 		 315 aa  44.7  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.06 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  35.04 
 
 		 308 aa  44.3  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0733  phosphohistidine phosphatase SixA, putative  28.21 
 
 		 163 aa  44.3  0.0009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00220786  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0539  phosphohistidine phosphatase  28.67 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 296 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0088  phosphoglycerate mutase family protein  27.27 
 
 		 246 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  33.59 
 
 		 325 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.31 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  26.19 
 
 		 305 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  30.28 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.45 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1528  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.82 
 
 		 179 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  33.33 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  30.77 
 
 		 398 aa  41.6  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1113  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>