34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0166 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0166  integral membrane protein-like  100 
 
 
393 aa  747    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0174  integral membrane protein-like protein  91.41 
 
 
396 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0185  integral membrane protein-like protein  90.66 
 
 
396 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0175  integral membrane protein-like protein  74.41 
 
 
401 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115055  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  32.32 
 
 
456 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  35.27 
 
 
447 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  34.15 
 
 
475 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  35.69 
 
 
498 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  33.1 
 
 
435 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  33.91 
 
 
486 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  33.57 
 
 
485 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  31.31 
 
 
519 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  32.5 
 
 
499 aa  86.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  31.12 
 
 
586 aa  83.2  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  31.33 
 
 
523 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  30.89 
 
 
560 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  29.29 
 
 
510 aa  75.5  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  33.33 
 
 
564 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  29 
 
 
544 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  29 
 
 
544 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  29 
 
 
544 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  29.58 
 
 
535 aa  73.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  33.82 
 
 
490 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  33.33 
 
 
496 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  26.61 
 
 
485 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  31.61 
 
 
461 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  29.72 
 
 
465 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  27.68 
 
 
530 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  30.74 
 
 
474 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  28.85 
 
 
629 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  28.34 
 
 
561 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  29.81 
 
 
552 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  30.04 
 
 
488 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  31.36 
 
 
648 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0930893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>