More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2138 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  100 
 
 		 95 aa  188  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  55.79 
 
 		 95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  53.68 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  54.26 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  50.53 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  50.53 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  49.47 
 
 		 98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  46.32 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  48.42 
 
 		 95 aa  106  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  46.32 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  47.37 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  47.37 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  47.37 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  47.37 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  47.37 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  47.37 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  46.32 
 
 		 96 aa  100  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  46.32 
 
 		 96 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  46.32 
 
 		 96 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  46.32 
 
 		 96 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 95 aa  97.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  48.42 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  48.42 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  45.83 
 
 		 97 aa  90.5  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  44.57 
 
 		 97 aa  90.1  9e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  46.74 
 
 		 96 aa  89.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  42.86 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 95 aa  88.2  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  46.24 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  43.01 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  42.71 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  42.71 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  41.49 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 112 aa  84.7  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  40.66 
 
 		 98 aa  84.7  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 98 aa  84.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  43.75 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  37.89 
 
 		 131 aa  84.3  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  45.74 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  42.86 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 96 aa  83.6  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  43.62 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2589  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  43.01 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  44.57 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  38.95 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  40.22 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  40.43 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00746  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741883  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>