More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1381 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 
391 aa  789    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  66.15 
 
 
392 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  65.12 
 
 
390 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  67.18 
 
 
392 aa  520  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.45 
 
 
389 aa  472  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  56.58 
 
 
388 aa  455  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  54.9 
 
 
401 aa  455  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  55.64 
 
 
388 aa  455  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  55.79 
 
 
388 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  53.68 
 
 
390 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  52.76 
 
 
382 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  53.81 
 
 
382 aa  437  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  53.28 
 
 
382 aa  433  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.23 
 
 
385 aa  432  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.02 
 
 
385 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  54.23 
 
 
382 aa  428  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  53.02 
 
 
384 aa  426  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  49.47 
 
 
386 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.22 
 
 
387 aa  409  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.05 
 
 
390 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.04 
 
 
388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  52.74 
 
 
387 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.26 
 
 
388 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.35 
 
 
389 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  46.74 
 
 
391 aa  391  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  49.09 
 
 
384 aa  385  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  48.57 
 
 
392 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  47.52 
 
 
389 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  50.52 
 
 
388 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  46.84 
 
 
403 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  46.07 
 
 
390 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  48.15 
 
 
389 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  46.05 
 
 
402 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  44.47 
 
 
400 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  46.84 
 
 
391 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  43.95 
 
 
392 aa  364  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  46.72 
 
 
391 aa  363  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  43.49 
 
 
390 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  46.83 
 
 
395 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  43.23 
 
 
395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  44.42 
 
 
392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  43.92 
 
 
392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  44.21 
 
 
394 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  43.65 
 
 
392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  43.95 
 
 
394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  43.65 
 
 
406 aa  353  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  43.65 
 
 
392 aa  352  5e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  43.65 
 
 
392 aa  352  5e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  43.65 
 
 
392 aa  352  5e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  43.65 
 
 
392 aa  352  5e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  43.26 
 
 
409 aa  352  7e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  43.39 
 
 
392 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  43.39 
 
 
392 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  43.65 
 
 
396 aa  350  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  45.69 
 
 
425 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  43.15 
 
 
394 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  43.12 
 
 
392 aa  347  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  42.6 
 
 
397 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  43.95 
 
 
399 aa  346  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  42.6 
 
 
397 aa  345  5e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  42.71 
 
 
393 aa  345  7e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  42.71 
 
 
393 aa  345  7e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  42.56 
 
 
397 aa  345  8e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  42.93 
 
 
407 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  44.76 
 
 
393 aa  342  5.999999999999999e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  42.64 
 
 
406 aa  341  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  42.64 
 
 
406 aa  341  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  42.82 
 
 
394 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  44.39 
 
 
399 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  43.81 
 
 
413 aa  341  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  41.78 
 
 
421 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  41.56 
 
 
400 aa  340  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 
399 aa  339  4e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  42.38 
 
 
405 aa  340  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  42.46 
 
 
407 aa  339  5.9999999999999996e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  43.54 
 
 
394 aa  338  7e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  44.09 
 
 
399 aa  338  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  44.09 
 
 
400 aa  338  9e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  41.19 
 
 
394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  43.57 
 
 
399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  42.78 
 
 
399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  42.71 
 
 
405 aa  336  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  43.88 
 
 
399 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  41.34 
 
 
393 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2782  aminotransferase  43.23 
 
 
406 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  40.73 
 
 
393 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  40.93 
 
 
396 aa  334  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  42.86 
 
 
405 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  43.31 
 
 
399 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5806  aminotransferase  43.46 
 
 
406 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.658046  decreased coverage  0.00092388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6029  aminotransferase  43.46 
 
 
406 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0777497  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  40.77 
 
 
403 aa  332  6e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  43.04 
 
 
400 aa  332  6e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1648  aminotransferase  43.2 
 
 
405 aa  331  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  41.05 
 
 
411 aa  331  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  40.73 
 
 
391 aa  331  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3995  aminotransferase  42.71 
 
 
406 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3522  aminotransferase  42.26 
 
 
406 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0878596  normal  0.459618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  42.19 
 
 
405 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1394  aminotransferase class I and II  40.66 
 
 
408 aa  329  4e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>