46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2453 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2453  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  322  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00273719  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  41.43 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2187  hypothetical protein  44.36 
 
 		 173 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.772007  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  41.18 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  36.81 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  85.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  36.13 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  38.71 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2094  hypothetical protein  47.01 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175818  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1745  hypothetical protein  44.44 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0478  putative flavodoxin  27.85 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  35.09 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  25.32 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  30.7 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  26 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  25.98 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  25 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  29.46 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  26.45 
 
 		 489 aa  55.1  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  30.08 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0903  hypothetical protein  32.97 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000048234 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3716  hypothetical protein  26.88 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 297 aa  50.8  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  28.24 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  29.32 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  27.16 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  28.36 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  29.82 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  27.64 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1212  hypothetical protein  33.8 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  26.12 
 
 		 196 aa  48.5  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  25.17 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  32.06 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  30.16 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  27.71 
 
 		 176 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  27.71 
 
 		 176 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  27.14 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  23.91 
 
 		 221 aa  44.3  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  26.96 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1980  hypothetical protein  23.28 
 
 		 218 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.838314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2384  hypothetical protein  27.97 
 
 		 161 aa  42  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  24.5 
 
 		 185 aa  42  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  25.88 
 
 		 141 aa  41.2  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16830  hypothetical protein  30.69 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.547063  normal  0.789104 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>