More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1911 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1911  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 157 aa  298  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.162967  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  64.38 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  69.23 
 
 		 161 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  69.23 
 
 		 161 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  56.77 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  64.19 
 
 		 157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  63.12 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0581  CinA domain-containing protein  59.71 
 
 		 175 aa  150  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  54.11 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  58.7 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  54.11 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  54.11 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  56.41 
 
 		 414 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  58.82 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  57.75 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  59.29 
 
 		 413 aa  147  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  53.33 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  53.33 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  53.33 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  58.06 
 
 		 163 aa  147  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  54.48 
 
 		 165 aa  146  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  54.48 
 
 		 165 aa  146  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  54.48 
 
 		 165 aa  146  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  54.48 
 
 		 165 aa  146  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  54.48 
 
 		 165 aa  146  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  54.48 
 
 		 165 aa  146  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  54.48 
 
 		 165 aa  146  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  56.77 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  52.67 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0429  CinA domain-containing protein  60.28 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.962415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  55.71 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  58.09 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  55.71 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  54.48 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  50.67 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  56.58 
 
 		 414 aa  144  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  52.67 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  55.71 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  56.49 
 
 		 166 aa  143  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  53.1 
 
 		 165 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  57.82 
 
 		 218 aa  143  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  51.01 
 
 		 203 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  61.15 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  58.22 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  56.12 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  55 
 
 		 166 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  55 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  55 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  54.93 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  59.15 
 
 		 422 aa  140  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  50.36 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0880  competence/damage-inducible protein CinA  50.36 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.630467  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  57.14 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  57.14 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  52.45 
 
 		 414 aa  139  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  54.29 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  61.15 
 
 		 175 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  56.29 
 
 		 166 aa  138  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  49.3 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  52.6 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  51.97 
 
 		 437 aa  138  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  57.03 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  54.55 
 
 		 163 aa  137  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  55 
 
 		 166 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  57.86 
 
 		 413 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  54.29 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  54.29 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  52.59 
 
 		 413 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  54.29 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  54.29 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  54.29 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  52.86 
 
 		 420 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  54.29 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  54.29 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  57.25 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0076  CinA-like  58.99 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  53.9 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  54.17 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  54.36 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  52.14 
 
 		 166 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  56.94 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  56.34 
 
 		 422 aa  134  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  59.42 
 
 		 140 aa  134  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  51.47 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  50.74 
 
 		 165 aa  133  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1113  competence damage-inducible protein A  47.4 
 
 		 164 aa  133  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  50 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  51.45 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  51.39 
 
 		 164 aa  132  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1285  CinA domain protein  54.6 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.982148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3214  competence damage-inducible protein A  48.7 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  50.72 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0483  CinA domain protein  60.42 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  57.04 
 
 		 421 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  57.04 
 
 		 421 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  52.82 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0554  putative competence-damaged protein, CinA-like  49.66 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  54.2 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  53.38 
 
 		 371 aa  131  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  54.2 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>