More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0546 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 		 453 aa  916    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  45.16 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  46.17 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  39.5 
 
 		 458 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  42.89 
 
 		 463 aa  344  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  39.73 
 
 		 458 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  42.33 
 
 		 466 aa  342  7e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  39.5 
 
 		 458 aa  342  9e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  43.51 
 
 		 455 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  40.28 
 
 		 458 aa  341  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  39.27 
 
 		 458 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  39.44 
 
 		 458 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  39.21 
 
 		 458 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  39.21 
 
 		 458 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  39.22 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  39.44 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  39.44 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  39.21 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  38.98 
 
 		 458 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  38.99 
 
 		 460 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  38.99 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  38.76 
 
 		 460 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  38.76 
 
 		 460 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  37.25 
 
 		 456 aa  325  9e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  38.28 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  40.31 
 
 		 459 aa  323  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  42.69 
 
 		 443 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  37.93 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  42.6 
 
 		 471 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  43.26 
 
 		 456 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  40.04 
 
 		 464 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  42.27 
 
 		 454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  41.79 
 
 		 450 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  42.27 
 
 		 454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  40.46 
 
 		 455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  40 
 
 		 455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  41.06 
 
 		 455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  39.31 
 
 		 455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  40.83 
 
 		 451 aa  303  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  36.87 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  39.6 
 
 		 464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  40.53 
 
 		 454 aa  302  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  39.38 
 
 		 468 aa  302  9e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  42.92 
 
 		 479 aa  301  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  40.32 
 
 		 459 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  40.41 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  40.32 
 
 		 454 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  40.32 
 
 		 454 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  42.32 
 
 		 458 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  40.32 
 
 		 454 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  40 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  36.3 
 
 		 472 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  36.3 
 
 		 472 aa  293  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  36.3 
 
 		 472 aa  293  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  36.3 
 
 		 472 aa  293  5e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  36.3 
 
 		 472 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  36.3 
 
 		 472 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  36.3 
 
 		 472 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  36.3 
 
 		 472 aa  292  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  36.47 
 
 		 472 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  35.84 
 
 		 472 aa  289  7e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  38.75 
 
 		 459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  39.91 
 
 		 445 aa  285  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  39.67 
 
 		 445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  39.67 
 
 		 445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  36.7 
 
 		 459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  34.42 
 
 		 465 aa  259  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  36.16 
 
 		 444 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  35.86 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  34.16 
 
 		 476 aa  248  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  35.93 
 
 		 444 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  34.16 
 
 		 476 aa  246  6.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  34.85 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  35.31 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  35.08 
 
 		 452 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  35.75 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  35.32 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  33.71 
 
 		 476 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  34.95 
 
 		 444 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0800  glutamine synthetase  33.71 
 
 		 478 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44189  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0825  glutamate--ammonia ligase  34.92 
 
 		 456 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.951182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2864  glutamate--ammonia ligase  35.07 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.149371 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  35.57 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  33.71 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  35.57 
 
 		 456 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  35.57 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  33.71 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  35.57 
 
 		 456 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  35.57 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0302  glutamate--putrescine ligase  34.31 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  34.57 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  34.57 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  34.57 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1785  glutamine synthetase catalytic region  34.22 
 
 		 448 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  35.33 
 
 		 444 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  35.33 
 
 		 490 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  34.11 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2178  glutamine synthetase, putative  34 
 
 		 448 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  33.87 
 
 		 445 aa  236  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3559  glutamine synthetase, catalytic region  34 
 
 		 448 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>