41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4638 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4638  cytochrome c, class I  100 
 
 		 361 aa  755    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  31.25 
 
 		 189 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1415  cytochrome c class I  31.18 
 
 		 123 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  30.39 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  44.23 
 
 		 653 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  29 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2376  hypothetical protein  30 
 
 		 224 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256417  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02058  Cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.63 
 
 		 113 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00379379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3248  cytochrome c, class I  30.36 
 
 		 143 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1272  cytochrome c, class I  30.36 
 
 		 143 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3282  cytochrome c, class IC  31.13 
 
 		 118 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  28.43 
 
 		 387 aa  46.6  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2070  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.59 
 
 		 317 aa  46.6  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  30.85 
 
 		 511 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.83 
 
 		 450 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.96 
 
 		 575 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1391  cytochrome c, class I  28.3 
 
 		 151 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  29.91 
 
 		 469 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 683 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  31.62 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.42 
 
 		 470 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0703  cytochrome c class I  29.9 
 
 		 139 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5322  cytochrome c class I  32.73 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0021785  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  31.62 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  30.69 
 
 		 524 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  28.81 
 
 		 432 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  28.81 
 
 		 432 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  28.81 
 
 		 432 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  28.81 
 
 		 432 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  28.81 
 
 		 432 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  32.22 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  28.81 
 
 		 432 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  28.81 
 
 		 432 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  30 
 
 		 653 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  33.65 
 
 		 220 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  30.43 
 
 		 350 aa  43.5  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3596  hypothetical protein  28.7 
 
 		 144 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.705754 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  28.28 
 
 		 154 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4209  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  30.56 
 
 		 1182 aa  42.7  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  28.1 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2649  cytochrome c, class IC  32.71 
 
 		 118 aa  42.7  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>