More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0987 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  320  8e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  40.87 
 
 		 137 aa  92.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 148 aa  87.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 148 aa  87.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 		 145 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  44.23 
 
 		 140 aa  85.5  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  44 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  38.93 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  44.04 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  43.24 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  43.24 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  43.24 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  43.24 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  43.12 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  36.27 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  38.89 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  42 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  42.2 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  40.91 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  41.44 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  41.44 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  41.44 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  33.94 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  39.81 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  33.07 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  37.14 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  38.66 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  39.36 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  36.54 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  37.82 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2233  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  39.6 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.96 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  34.71 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.96 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.96 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.96 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.96 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  38.33 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  39.81 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  31.9 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  40.82 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2675  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  34.96 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  33.03 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  29.08 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  28.97 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  28.97 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  36.79 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  36.79 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  32.62 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3212  MerR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356219  normal  0.122177 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>