More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1787 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  100 
 
 
141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  64.71 
 
 
127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  64.71 
 
 
127 aa  157  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  64.17 
 
 
131 aa  154  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  61.34 
 
 
127 aa  154  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  63.25 
 
 
123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  61.98 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  49.58 
 
 
124 aa  125  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  42.02 
 
 
121 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  42.02 
 
 
121 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
121 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  40.68 
 
 
122 aa  102  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  42.02 
 
 
121 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  42.15 
 
 
121 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  41.59 
 
 
121 aa  100  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
122 aa  100  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
124 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  42.86 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
394 aa  99.4  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  42.37 
 
 
121 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0067  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
122 aa  99.4  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 
121 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  38.66 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  41.59 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  40.71 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  37.17 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  40.74 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  40.71 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  37.17 
 
 
127 aa  96.3  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  40.71 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  41.59 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  42.48 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  41.59 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  41.59 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  41.59 
 
 
127 aa  94.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  38.94 
 
 
121 aa  94.4  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
121 aa  94  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
126 aa  93.6  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  40.95 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  42.11 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
127 aa  92.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  39.82 
 
 
139 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  39.82 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  39.82 
 
 
127 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  40 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  39.82 
 
 
127 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  38.46 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3542  response regulator receiver  35.96 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  39.82 
 
 
128 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  39.82 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
129 aa  90.9  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2874  response regulator receiver  45.13 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  39.82 
 
 
127 aa  90.9  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  41.59 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  41.03 
 
 
129 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  40.71 
 
 
129 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
135 aa  90.1  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  39.82 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  40.35 
 
 
132 aa  89.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  38.05 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  39.29 
 
 
121 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  38.05 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  38.94 
 
 
124 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  37.17 
 
 
131 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  39.82 
 
 
129 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 
126 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  38.05 
 
 
123 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  38.05 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  38.05 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  38.05 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  38.05 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  38.05 
 
 
123 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  38.05 
 
 
127 aa  88.6  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  38.05 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  37.17 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  38.05 
 
 
127 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  37.96 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2191  response regulator receiver protein  37.72 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  40.71 
 
 
131 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  40.71 
 
 
131 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 
123 aa  88.2  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  40.71 
 
 
131 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
128 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3583  response regulator receiver protein  39.64 
 
 
125 aa  88.2  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
131 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  38.05 
 
 
128 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>