More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0403 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  74.45 
 
 
510 aa  761    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0033  propionyl-CoA carboxylase  74.45 
 
 
510 aa  750    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  73.47 
 
 
523 aa  762    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  66.33 
 
 
508 aa  637    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2360  propionyl-CoA carboxylase  62.53 
 
 
513 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  64.67 
 
 
518 aa  638    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  61.63 
 
 
513 aa  636    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0403  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 
510 aa  1018    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  73.07 
 
 
506 aa  753    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  62.53 
 
 
520 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2807  carboxyl transferase domain protein  61.72 
 
 
513 aa  631  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977821 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  61.72 
 
 
513 aa  631  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2553  carboxyl transferase domain-containing protein  61.52 
 
 
513 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2375  carboxyl transferase domain-containing protein  61.72 
 
 
513 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2332  propionyl-CoA carboxylase  61.52 
 
 
513 aa  628  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2552  carboxyl transferase domain-containing protein  61.72 
 
 
513 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.953071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2608  carboxyl transferase domain protein  61.52 
 
 
513 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.444131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  63.86 
 
 
517 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  61.32 
 
 
513 aa  627  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  61.32 
 
 
513 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2164  propionyl-CoA carboxylase  63.12 
 
 
522 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.207678  normal  0.196324 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2300  Sigma 54 interacting domain protein  63.09 
 
 
513 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.535149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2212  Propionyl-CoA carboxylase  62.89 
 
 
513 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08220  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  60.69 
 
 
537 aa  592  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1646  propionyl-CoA carboxylase  63.73 
 
 
524 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2122  Propionyl-CoA carboxylase  45.91 
 
 
625 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.893863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0008  Propionyl-CoA carboxylase  45.12 
 
 
607 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2454  carboxyl transferase  43.44 
 
 
612 aa  433  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2913  Propionyl-CoA carboxylase  45.16 
 
 
586 aa  432  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.615692  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  42.63 
 
 
508 aa  397  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  44.27 
 
 
525 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  44.96 
 
 
516 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  42.02 
 
 
531 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  45.22 
 
 
516 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  40.78 
 
 
513 aa  374  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  41.81 
 
 
514 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  41.83 
 
 
534 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  41.65 
 
 
516 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  41.03 
 
 
516 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  41.45 
 
 
517 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  41.28 
 
 
526 aa  368  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  40.5 
 
 
527 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  40.75 
 
 
521 aa  364  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  43.88 
 
 
519 aa  363  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  40.59 
 
 
527 aa  364  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  38.28 
 
 
518 aa  363  4e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  41.37 
 
 
530 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  42.36 
 
 
550 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  40.35 
 
 
536 aa  363  6e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  40.24 
 
 
531 aa  362  8e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  39.02 
 
 
512 aa  362  9e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  41.3 
 
 
542 aa  361  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  40.78 
 
 
520 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  38.87 
 
 
514 aa  360  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  40.82 
 
 
516 aa  359  6e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  40.55 
 
 
520 aa  359  8e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  38.55 
 
 
515 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  38.9 
 
 
513 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  40.31 
 
 
524 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  40.08 
 
 
531 aa  356  5.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  38.55 
 
 
515 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  39.8 
 
 
522 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  39.4 
 
 
515 aa  355  1e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  40.86 
 
 
514 aa  354  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0201  carboxyl transferase  37.71 
 
 
521 aa  354  2e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0217258  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  37.35 
 
 
514 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  39.36 
 
 
516 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  37.77 
 
 
518 aa  354  2.9999999999999997e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  37.7 
 
 
516 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  40.43 
 
 
531 aa  353  4e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  40.66 
 
 
510 aa  353  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  40.93 
 
 
518 aa  353  5e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  39.57 
 
 
519 aa  351  1e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  40.27 
 
 
527 aa  351  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  40.67 
 
 
538 aa  352  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  39.65 
 
 
522 aa  350  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  38.51 
 
 
513 aa  350  4e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  39.26 
 
 
516 aa  349  5e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  38.97 
 
 
516 aa  349  6e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  40.36 
 
 
532 aa  349  7e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  39.3 
 
 
551 aa  348  9e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  38.97 
 
 
516 aa  348  1e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  38.87 
 
 
517 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  39.07 
 
 
513 aa  348  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  41.24 
 
 
532 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  39.25 
 
 
513 aa  348  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  38.99 
 
 
517 aa  347  2e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  38.91 
 
 
552 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  39.77 
 
 
527 aa  347  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  40.28 
 
 
517 aa  347  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  39.01 
 
 
512 aa  347  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  37.99 
 
 
522 aa  347  4e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  39.22 
 
 
529 aa  346  5e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  37.35 
 
 
516 aa  346  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  39.61 
 
 
516 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  38.82 
 
 
513 aa  346  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  38.68 
 
 
524 aa  346  7e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  38.87 
 
 
514 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  39.69 
 
 
510 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  40.32 
 
 
537 aa  345  1e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>