138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0210 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0210  translation initiation factor SUI1  100 
 
 		 98 aa  193  6e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2911  translation initiation factor Sui1  52.69 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1997  translation initiation factor Sui1  53.26 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1902  translation initiation factor Sui1  51.09 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2534  translation initiation factor Sui1  53.93 
 
 		 97 aa  104  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0321  translation initiation factor Sui1  48.39 
 
 		 101 aa  103  9e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0627  translation initiation factor Sui1  52.81 
 
 		 97 aa  103  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.344568  normal  0.0369514 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1589  translation initiation factor SUI1  52.81 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1990  translation initiation factor Sui1  48.39 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1391  translation initiation factor Sui1  51.06 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3580  translation initiation factor SUI1  51.69 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0717  translation initiation factor Sui1  48.94 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00154405  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0366  translation initiation factor Sui1  49.44 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485747  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0172  translation initiation factor Sui1  48.94 
 
 		 102 aa  97.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0000141332  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0651  translation initiation factor Sui1  48.94 
 
 		 102 aa  97.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000000000433453  decreased coverage  0.0000613351 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1267  translation initiation factor Sui1  48.94 
 
 		 102 aa  97.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000000776224  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2078  translation initiation factor Sui1  52.81 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.157753  normal  0.161852 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0534  translation initiation factor Sui1  44.09 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2049  translation initiation factor Sui1  44.09 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  9.06796e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1423  translation initiation factor SUI1  52.22 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2210  translation initiation factor Sui1  53.33 
 
 		 99 aa  90.9  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000269686 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0760  translation initiation factor SUI1  50 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0622  translation initiation factor SUI1  43.01 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3637  translation initiation factor SUI1  44.87 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0505  translation initiation factor SUI1  47.44 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.583781  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2075  translation initiation factor SUI1  41.77 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0636  translation initiation factor Sui1  53.03 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3941  translation initiation factor SUI1  38.46 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1754  translation initiation factor SUI1  40.62 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000113267  hitchhiker  0.00210388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0471  translation initiation factor SUI1  40.48 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3853  translation initiation factor SUI1  37.78 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1574  translation initiation factor SUI1  40.7 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0584  translation initiation factor SUI1  38.54 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00019387 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0438  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  41.86 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2471  translation initiation factor Sui1  43.21 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.827071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000152  translation initiation factor SUI1-related protein  48.48 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05783  translation initiation factor Sui1  48.48 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01715  Sui1 family protein  44.59 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2854  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  40 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339586  normal  0.0877983 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0972  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  45.16 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3176  translation initiation factor Sui1  42.5 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00012053  hitchhiker  0.0057416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1917  translation initiation factor Sui1  41.3 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000003145  hitchhiker  0.00000000000000420932 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0267  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  45.45 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3018  translation initiation factor Sui1  42.5 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000751139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1345  translation initiation factor Sui1  42.5 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00294429  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3033  translation initiation factor Sui1  42.5 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000199492  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4810  translation initiation factor Sui1  40.22 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1200  translation initiation factor Sui1  41.25 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000764802  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3345  translation initiation factor Sui1  41.89 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2964  translation initiation factor Sui1  38.89 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2364  translation initiation factor Sui1  45.31 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271288  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1201  translation initiation factor Sui1  40 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177618  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3154  translation initiation factor Sui1  38.89 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2680  translation initiation factor Sui1  41.25 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1912  translation initiation factor Sui1  45.31 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000470884  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2237  translation initiation factor Sui1  45.31 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0294222  normal  0.0125302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2023  translation initiation factor Sui1  45.31 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.785803  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01259  translation initiation factor Sui1  40.22 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000686676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2365  translation initiation factor SUI1  40.22 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110904  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4092  translation initiation factor SUI1  39.02 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01270  hypothetical protein  40.22 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1910  translation initiation factor Sui1  39.13 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1443  translation initiation factor SUI1  46.27 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  normal  0.134693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2580  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  40.91 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1271  translation initiation factor Sui1  40 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000428708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2865  translation initiation factor SUI1  47.69 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2186  translation initiation factor Sui1  45.31 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.019439  hitchhiker  0.000338309 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1394  translation initiation factor Sui1  40.22 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000598621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1485  translation initiation factor Sui1  40.22 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305323  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1133  translation initiation factor Sui1  40.54 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129077  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2344  translation initiation factor Sui1  40.22 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000454927  unclonable  0.000000015805 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1511  translation initiation factor Sui1  40.22 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000972273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1846  translation initiation factor Sui1  40.22 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000134227  hitchhiker  8.5212e-20 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1704  translation initiation factor SUI1  45.31 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00246322  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2639  translation initiation factor Sui1  43.75 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2646  translation initiation factor Sui1  43.75 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000146872  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2419  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  40 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2675  translation initiation factor Sui1  39.53 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000045449  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3343  translation initiation factor Sui1  34.52 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1737  translation initiation factor SUI1  43.75 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084137  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2851  translation initiation factor Sui1  38.27 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181646  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0563  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  41.54 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1163  translation initiation factor SUI1  39.24 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0953729  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3188  translation initiation factor SUI1  35.71 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00588203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0343  translation initiation factor Sui1  46.97 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000865275  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2203  translation initiation factor SUI1  39.68 
 
 		 114 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.513989 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1238  translation initiation factor Sui1  40.54 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.120876 
 
 
-
 
NC_002950  PG0248  translation initation factor SUI1, putative  40 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2142  translation initiation factor Sui1  39.47 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183879  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2734  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  40.91 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1592  translation initiation factor SUI1  43.94 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1830  translation initiation factor Sui1  42.19 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0277649  hitchhiker  8.595610000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1892  translation initiation factor Sui1  42.19 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000000000000626787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1835  translation initiation factor Sui1  42.19 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00136333  hitchhiker  0.000244384 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1625  translation initiation factor Sui1  42.19 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00194965  hitchhiker  4.78145e-19 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1443  translation initiation factor Sui1  42.19 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1480  translation initiation factor Sui1  44.62 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1185  translation initiation factor SUI1  40.91 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00309802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1338  translation initiation factor Sui1  39.19 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0446445  hitchhiker  0.000386966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4188  translation initiation factor SUI1  45.9 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>