155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2730 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  100 
 
 
254 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  37.76 
 
 
236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.76 
 
 
236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  36.8 
 
 
242 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  36.8 
 
 
242 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  36.8 
 
 
242 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  36.8 
 
 
242 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  36.36 
 
 
242 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  36.36 
 
 
242 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.02 
 
 
245 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.02 
 
 
245 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  38.18 
 
 
241 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.02 
 
 
242 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.02 
 
 
242 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.02 
 
 
242 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.02 
 
 
242 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  39.02 
 
 
242 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  37.79 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  35.93 
 
 
242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  38.54 
 
 
242 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  39.6 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  37.33 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  38.31 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.55 
 
 
247 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  34.56 
 
 
246 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.49 
 
 
240 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  35.12 
 
 
248 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  37.7 
 
 
242 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  36.94 
 
 
241 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  34.36 
 
 
237 aa  155  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  33.77 
 
 
245 aa  155  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  39.72 
 
 
252 aa  154  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  37.7 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  35.43 
 
 
248 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  35.43 
 
 
248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  38.89 
 
 
239 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  36.04 
 
 
237 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  37.38 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  32.89 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  31.9 
 
 
235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.99 
 
 
236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  32.57 
 
 
246 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  35.6 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  32.66 
 
 
238 aa  125  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  36.46 
 
 
276 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  34.05 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  31.22 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  30.9 
 
 
282 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  30.62 
 
 
272 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  30.74 
 
 
272 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.95 
 
 
241 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  29.47 
 
 
237 aa  85.9  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.95 
 
 
210 aa  85.1  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  28.71 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3011  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.46 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  30.1 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  26.46 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  27.72 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  27.62 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  30.34 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  27.6 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  24.89 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  26.21 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.94 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  25.73 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1327  protein-disulfide isomerase-like protein  28.57 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.94 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.51 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.05 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  24.81 
 
 
256 aa  72  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.29 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.94 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.44 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2275  protein-disulfide isomerase  27.39 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0963493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1150  hypothetical protein  27.94 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000405305  normal  0.155093 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  28.36 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.15 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0081  hypothetical protein  25.52 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0094  hypothetical protein  25.52 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.892093  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  25.24 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  27.78 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.6 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  22.98 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.6 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.6 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.6 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.6 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.77 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  27.78 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.76 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.6 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.6 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.6 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  22.66 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.56 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4008  hypothetical protein  25.1 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205255  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.94 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.76 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1208  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.17 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110909  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>