152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0094 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0081  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0094  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.892093  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  29.03 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  29.03 
 
 
241 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.12 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  28.42 
 
 
245 aa  82  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.19 
 
 
247 aa  82  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  28.72 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16050  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.24 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  28.8 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.84 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1382  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.24 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.14 
 
 
238 aa  79  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  27.62 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  27.62 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.62 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  25 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.53 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.84 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  25.84 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.84 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.96 
 
 
237 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.84 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  26.32 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.62 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4220  hypothetical protein  27.01 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  normal  0.507877 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  26.32 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.2 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.37 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  27.81 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  27.81 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  27.81 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  27.81 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.6 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.88 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  27.81 
 
 
242 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.84 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  27.27 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  25.95 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  28.42 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  27.27 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  26.87 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  26.76 
 
 
263 aa  72  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.49 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.49 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.49 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.49 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.49 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.49 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.88 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  27.03 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.49 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  26.49 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  25.56 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  27.67 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  28.99 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  25.76 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.71 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  28.42 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  26.63 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  25.52 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  26.26 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  25.77 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1479  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.1 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  24.1 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  26.67 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  24.46 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.48 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.48 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.48 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  27.66 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1535  hypothetical protein  26.13 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.480424  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  23.32 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4150  thiol:disulfide interchange protein DsbC  21.21 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.466954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  26.8 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  26.54 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  27.05 
 
 
272 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  22.75 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  24.38 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.75 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  25.11 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  26.34 
 
 
232 aa  63.5  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3303  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00340297  normal  0.257142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  21.13 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  25.46 
 
 
262 aa  62.4  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.47 
 
 
237 aa  62  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4252  thiol:disulfide interchange protein DsbC  20.2 
 
 
247 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.5 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.5 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.5 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1074  thiol:disulfide interchange protein DsbC  20.2 
 
 
247 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.211373  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  25 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0642  thiol:disulfide interchange protein  23.1 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.374404  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.56 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  25.75 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  25.21 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>