88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1926 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  69.15 
 
 
653 aa  886    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  67.68 
 
 
678 aa  899    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  64.12 
 
 
630 aa  803    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  66.51 
 
 
652 aa  884    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1926  putative exported alkaline phosphatase  100 
 
 
651 aa  1340    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2465  phosphatase-like protein  65.96 
 
 
678 aa  874    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  68.34 
 
 
653 aa  875    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  66.21 
 
 
650 aa  887    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  69.15 
 
 
653 aa  886    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  67.68 
 
 
678 aa  899    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  69.15 
 
 
653 aa  884    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3826  hypothetical protein  63.96 
 
 
662 aa  843    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.984563  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  66.82 
 
 
650 aa  894    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  69.15 
 
 
653 aa  884    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2020  twin-arginine translocation pathway signal  56.88 
 
 
648 aa  699    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  70.36 
 
 
653 aa  900    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  67.07 
 
 
651 aa  901    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  67.37 
 
 
654 aa  897    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  67.88 
 
 
654 aa  902    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2071  phosphatase-like protein  57.48 
 
 
688 aa  712    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2297  phosphatase-like protein  62.58 
 
 
631 aa  798    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937411  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  69.15 
 
 
653 aa  884    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5110  putative exported alkaline phosphatase  70.63 
 
 
673 aa  934    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  67.33 
 
 
653 aa  887    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  69.15 
 
 
653 aa  886    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5329  putative exported alkaline phosphatase  82.18 
 
 
650 aa  1116    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1083  hypothetical protein  42.7 
 
 
623 aa  458  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.638894  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7168  putative exported alkaline phosphatase  71.85 
 
 
253 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  35.71 
 
 
583 aa  291  4e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  34.54 
 
 
607 aa  250  5e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  35.99 
 
 
630 aa  239  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  36.14 
 
 
625 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  27.23 
 
 
626 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  28.27 
 
 
624 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  29.45 
 
 
631 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  27.7 
 
 
612 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  28.14 
 
 
883 aa  78.2  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  29.82 
 
 
884 aa  75.5  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  25.08 
 
 
887 aa  68.2  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  22.41 
 
 
696 aa  66.6  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  24.13 
 
 
699 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  24.01 
 
 
699 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  24.01 
 
 
699 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  24.03 
 
 
662 aa  61.2  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  32.68 
 
 
587 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  26.29 
 
 
596 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  23.7 
 
 
680 aa  58.9  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  24.64 
 
 
738 aa  58.9  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  28.85 
 
 
593 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3891  hypothetical protein  25.23 
 
 
736 aa  57  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  22.68 
 
 
593 aa  54.7  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  23.82 
 
 
715 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  28.89 
 
 
476 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  24.09 
 
 
672 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  27.56 
 
 
593 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  22.41 
 
 
667 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  23.88 
 
 
672 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  24.08 
 
 
704 aa  51.6  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  23.74 
 
 
638 aa  50.8  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0721  hypothetical protein  24.36 
 
 
629 aa  50.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.829101 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  30.43 
 
 
458 aa  50.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  24.71 
 
 
659 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  24.71 
 
 
659 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  29.17 
 
 
786 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  25.7 
 
 
633 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  27.45 
 
 
632 aa  48.9  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3474  hypothetical protein  25.76 
 
 
663 aa  48.5  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  26.04 
 
 
663 aa  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2144  hypothetical protein  22.52 
 
 
718 aa  48.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.202343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  25.14 
 
 
639 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  22.42 
 
 
638 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  22 
 
 
693 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  24.65 
 
 
702 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0954  twin-arginine translocation pathway signal  26.46 
 
 
658 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30440  predicted phosphatase  29.8 
 
 
821 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  26.09 
 
 
383 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1652  hypothetical protein  24.15 
 
 
741 aa  45.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.875802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2564  protein of unknown function DUF839  24.28 
 
 
674 aa  45.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.200844  normal  0.0537939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2555  twin-arginine translocation pathway signal  22.91 
 
 
627 aa  44.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  28.78 
 
 
708 aa  44.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  28.82 
 
 
669 aa  44.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5151  protein of unknown function DUF839  26.7 
 
 
755 aa  44.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  29.68 
 
 
694 aa  44.3  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3201  twin-arginine translocation pathway signal  29.01 
 
 
494 aa  43.9  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0378745  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1844  hypothetical protein  23.06 
 
 
744 aa  44.3  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4663  protein of unknown function DUF839  23.06 
 
 
651 aa  43.9  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  27.42 
 
 
689 aa  43.9  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  21.99 
 
 
386 aa  43.9  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.930248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>