38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2503 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  698    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  676    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0204  hypothetical protein  35.36 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  30.74 
 
 		 366 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  39.24 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  38.61 
 
 		 357 aa  92.4  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  38.82 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  36.3 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  25.19 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  32.67 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  36.77 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  36.77 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  28.69 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  28.69 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  23.31 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  32.08 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  33.13 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  39.44 
 
 		 472 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  39.44 
 
 		 472 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  39.44 
 
 		 497 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  39.44 
 
 		 497 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  31.65 
 
 		 410 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5059  hypothetical protein  26.36 
 
 		 268 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5215  hypothetical protein  24.7 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3153  hypothetical protein  24.7 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  32.91 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  44 
 
 		 183 aa  50.4  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0545  hypothetical protein  29.17 
 
 		 495 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  44.19 
 
 		 568 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  33.01 
 
 		 425 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5413  hypothetical protein  43.75 
 
 		 250 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5595  hypothetical protein  43.75 
 
 		 250 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0054  hypothetical protein  29.69 
 
 		 203 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  42.5 
 
 		 455 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5415  hypothetical protein  37.74 
 
 		 849 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5593  hypothetical protein  37.74 
 
 		 849 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1705  hypothetical protein  27.48 
 
 		 193 aa  42.7  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3570  hypothetical protein  32.05 
 
 		 405 aa  42.7  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>