More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4484 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  100 
 
 		 244 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  89.64 
 
 		 242 aa  356  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4475  GrpE protein  64.5 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323495  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  41.85 
 
 		 190 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  43.21 
 
 		 210 aa  129  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  46.27 
 
 		 188 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  42.65 
 
 		 199 aa  125  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  47.73 
 
 		 186 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  45 
 
 		 181 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  44.29 
 
 		 200 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  46.48 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  42.75 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  34.5 
 
 		 213 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  39.57 
 
 		 208 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  43.61 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  36.05 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  35.84 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  43.36 
 
 		 179 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  36.32 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  43.8 
 
 		 173 aa  112  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  37.74 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  37.74 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  37.74 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  37.74 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  45 
 
 		 198 aa  109  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  43.36 
 
 		 171 aa  109  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  38.85 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  45.71 
 
 		 194 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  37.58 
 
 		 206 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  39.57 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  40.56 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  43.24 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  35.53 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  36.94 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 186 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  37.25 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  36.9 
 
 		 189 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  34.08 
 
 		 188 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  34.08 
 
 		 188 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  39.46 
 
 		 189 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 		 198 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  34.08 
 
 		 188 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  34.08 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  34.08 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  34.08 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  34.08 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  34.08 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  38.73 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  34.38 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  35.47 
 
 		 187 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  37.67 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  40 
 
 		 156 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  35.47 
 
 		 187 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  35.42 
 
 		 223 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  36.17 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  36.17 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  36.99 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  36.05 
 
 		 179 aa  103  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  36.81 
 
 		 190 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  37.16 
 
 		 181 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  40.43 
 
 		 190 aa  102  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  38.78 
 
 		 186 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35 
 
 		 189 aa  102  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  35.67 
 
 		 206 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  35.9 
 
 		 185 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  39.31 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  34.13 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  34.39 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  38.82 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  35.59 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  37.34 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  33.98 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  37.84 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  36.54 
 
 		 185 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  38.69 
 
 		 191 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  33.5 
 
 		 200 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  37.34 
 
 		 180 aa  99.8  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  39.01 
 
 		 181 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  35.26 
 
 		 178 aa  99.8  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  35.59 
 
 		 197 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  37.86 
 
 		 200 aa  99.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  38.03 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  35.03 
 
 		 197 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  35.03 
 
 		 196 aa  99  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  35.03 
 
 		 197 aa  99  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 212 aa  99  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  35.03 
 
 		 197 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  35.03 
 
 		 197 aa  99  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  35.03 
 
 		 197 aa  99  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  35.97 
 
 		 197 aa  99  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  34.86 
 
 		 197 aa  99  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1378  heat shock protein GrpE  36.88 
 
 		 192 aa  98.6  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000995394  normal  0.160188 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2974  heat shock protein GrpE  36.88 
 
 		 192 aa  98.6  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2887  heat shock protein GrpE  36.88 
 
 		 192 aa  98.6  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.654980000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  31.18 
 
 		 210 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  36.57 
 
 		 188 aa  98.6  9e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  36.02 
 
 		 184 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  32.52 
 
 		 195 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>