24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3119 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2927  hypothetical protein  96.24 
 
 		 649 aa  1157    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.956514  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3119  hypothetical protein  100 
 
 		 645 aa  1294    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3012  hypothetical protein  97.67 
 
 		 649 aa  1206    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0326564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2881  hypothetical protein  41.16 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2156  hypothetical protein  40.91 
 
 		 543 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849073  normal  0.0510024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  35.29 
 
 		 969 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  32.42 
 
 		 881 aa  170  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2259  cytochrome c5530 family protein  28.71 
 
 		 1069 aa  150  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  29.33 
 
 		 559 aa  147  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  28.34 
 
 		 897 aa  143  9e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2160  cytochrome c5530 family protein  31.38 
 
 		 1062 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.870345  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0274  cytochrome c, class I  28.51 
 
 		 589 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0423  cytochrome c5530  31.61 
 
 		 1158 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183193  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0421  cytochrome c5530 family protein  30.47 
 
 		 1107 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0800072  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  28.1 
 
 		 581 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  30.13 
 
 		 643 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  27.85 
 
 		 841 aa  90.1  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1703  hypothetical protein  25.48 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000330432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.9 
 
 		 1451 aa  58.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.46 
 
 		 1453 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2829  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.5 
 
 		 999 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4209  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.72 
 
 		 1618 aa  48.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  49.25 
 
 		 1202 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  35.71 
 
 		 800 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>