More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1686 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  310  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  98.66 
 
 
149 aa  306  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  55.56 
 
 
165 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  58.22 
 
 
169 aa  162  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.7 
 
 
164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.69 
 
 
168 aa  161  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  57.53 
 
 
172 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  57.53 
 
 
172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  57.53 
 
 
172 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  54.17 
 
 
168 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  57.53 
 
 
172 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  57.53 
 
 
172 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.42 
 
 
164 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  56.16 
 
 
167 aa  160  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  56.16 
 
 
167 aa  160  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56.16 
 
 
167 aa  160  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  56.16 
 
 
167 aa  160  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  56.16 
 
 
178 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  56.16 
 
 
178 aa  159  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  53.74 
 
 
166 aa  159  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  56.16 
 
 
178 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  56.16 
 
 
178 aa  159  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.42 
 
 
170 aa  158  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.1 
 
 
175 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.1 
 
 
175 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.1 
 
 
175 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  54.17 
 
 
223 aa  157  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  55.48 
 
 
178 aa  157  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.34 
 
 
169 aa  157  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.78 
 
 
177 aa  157  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.38 
 
 
189 aa  157  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.05 
 
 
174 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  52.38 
 
 
200 aa  156  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  53.06 
 
 
177 aa  156  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  52.38 
 
 
187 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  52.38 
 
 
200 aa  155  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.42 
 
 
162 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  50.68 
 
 
222 aa  154  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.24 
 
 
163 aa  153  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.34 
 
 
182 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.34 
 
 
182 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  54.05 
 
 
190 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.35 
 
 
252 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  52 
 
 
155 aa  150  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  50.68 
 
 
222 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  54.17 
 
 
182 aa  150  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
152 aa  149  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  49.66 
 
 
177 aa  148  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.32 
 
 
152 aa  148  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.66 
 
 
177 aa  148  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  48.98 
 
 
183 aa  147  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  52.45 
 
 
158 aa  147  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.66 
 
 
176 aa  144  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.98 
 
 
176 aa  145  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.34 
 
 
178 aa  144  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  51.68 
 
 
170 aa  143  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.08 
 
 
181 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.7 
 
 
174 aa  143  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.34 
 
 
179 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50 
 
 
175 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  50.68 
 
 
172 aa  143  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  48.3 
 
 
182 aa  142  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.34 
 
 
361 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.34 
 
 
361 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  54.41 
 
 
137 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  51.02 
 
 
158 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  49.66 
 
 
168 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.98 
 
 
475 aa  141  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  47.62 
 
 
159 aa  140  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.35 
 
 
194 aa  140  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.28 
 
 
484 aa  139  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  48.95 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  48.32 
 
 
152 aa  138  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  46.15 
 
 
189 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  47.59 
 
 
161 aa  137  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  46.26 
 
 
193 aa  137  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.62 
 
 
166 aa  137  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  47.65 
 
 
148 aa  136  7e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  47.65 
 
 
148 aa  136  7e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.94 
 
 
160 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.62 
 
 
166 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.95 
 
 
167 aa  136  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.28 
 
 
157 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.9 
 
 
156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.9 
 
 
156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  47.33 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  46.15 
 
 
177 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  48.23 
 
 
177 aa  134  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  44.76 
 
 
151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  48.97 
 
 
165 aa  133  8e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.97 
 
 
165 aa  133  8e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.3 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.32 
 
 
461 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1349  hypothetical protein  53.91 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15680  hypothetical protein  51.35 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0652995  hitchhiker  0.000000000000295358 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  42.36 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  47.62 
 
 
165 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  46.26 
 
 
171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>