145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1199 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  71.68 
 
 
526 aa  664    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  988    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  36.27 
 
 
620 aa  190  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  41.25 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  39.06 
 
 
485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  28.09 
 
 
546 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  27.84 
 
 
561 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  33.1 
 
 
464 aa  96.3  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  45.92 
 
 
661 aa  93.6  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  28.15 
 
 
408 aa  92.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  43.88 
 
 
469 aa  92.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  28.34 
 
 
407 aa  91.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  32.25 
 
 
494 aa  90.1  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  26.39 
 
 
432 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  41.03 
 
 
572 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  27.91 
 
 
413 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  31 
 
 
442 aa  87.8  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  43.88 
 
 
627 aa  87.4  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  26.97 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  29.03 
 
 
516 aa  74.7  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  41.35 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  31 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  31.79 
 
 
512 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  23.04 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  37.39 
 
 
568 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  35.9 
 
 
566 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  36.11 
 
 
620 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  27.97 
 
 
493 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  33.75 
 
 
605 aa  64.3  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  34.78 
 
 
585 aa  64.3  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  29.51 
 
 
580 aa  63.9  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  26.24 
 
 
490 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  27.27 
 
 
492 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0359  HNH endonuclease  24.87 
 
 
433 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3201  HNH endonuclease  25.12 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  27.27 
 
 
492 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  26.22 
 
 
444 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  26.22 
 
 
444 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  34.62 
 
 
530 aa  61.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  26.22 
 
 
444 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2505  HNH endonuclease  25 
 
 
433 aa  60.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  33.07 
 
 
580 aa  60.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  35.71 
 
 
418 aa  60.5  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  28.17 
 
 
499 aa  60.5  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  33.33 
 
 
603 aa  60.1  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  26.22 
 
 
448 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  26.39 
 
 
442 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  26.39 
 
 
442 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  33.6 
 
 
418 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  26.57 
 
 
473 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  25.87 
 
 
447 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  26.92 
 
 
448 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  24.54 
 
 
519 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  31.28 
 
 
504 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  33.33 
 
 
510 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  36.22 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  23.92 
 
 
507 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  24.54 
 
 
507 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  23.92 
 
 
507 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  24.54 
 
 
507 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  23.92 
 
 
507 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  36.36 
 
 
553 aa  57.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2460  HNH endonuclease  24.65 
 
 
428 aa  57.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  24.54 
 
 
519 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  26.62 
 
 
446 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  33.33 
 
 
584 aa  56.6  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  26.57 
 
 
473 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  26.57 
 
 
473 aa  57  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1508  HNH endonuclease  24.54 
 
 
436 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000388947  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  26.62 
 
 
492 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2278  HNH endonuclease  24.19 
 
 
440 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.214719 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  33.64 
 
 
558 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  34.65 
 
 
535 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  25.83 
 
 
593 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  25.85 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4589  HNH endonuclease  24.34 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  38.04 
 
 
414 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  27.17 
 
 
434 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  39.53 
 
 
418 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  34.48 
 
 
551 aa  54.3  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  24.02 
 
 
507 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  33.33 
 
 
255 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  26.53 
 
 
436 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  25.78 
 
 
511 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3947  HNH endonuclease  24.07 
 
 
433 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  32.23 
 
 
628 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  25.69 
 
 
534 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  25.69 
 
 
533 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  36.46 
 
 
480 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  36.46 
 
 
489 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  37.21 
 
 
437 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  23.13 
 
 
464 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  36.46 
 
 
466 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  26.3 
 
 
472 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  36.46 
 
 
481 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  34.29 
 
 
714 aa  50.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  35.04 
 
 
440 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  37.33 
 
 
437 aa  50.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  30 
 
 
526 aa  50.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  35.09 
 
 
256 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>