More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1065 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  80.87 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  67.83 
 
 		 122 aa  167  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  66.37 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  70.54 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  67.86 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  66.09 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  62.71 
 
 		 120 aa  161  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  60.66 
 
 		 123 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  59.02 
 
 		 123 aa  159  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  67.23 
 
 		 126 aa  157  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  60.16 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  57.72 
 
 		 124 aa  153  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  60.16 
 
 		 124 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  60.16 
 
 		 124 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  54.92 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  56.1 
 
 		 125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  55.28 
 
 		 125 aa  150  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  63.79 
 
 		 143 aa  150  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  60 
 
 		 125 aa  150  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  57.38 
 
 		 123 aa  149  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  61.42 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  57.39 
 
 		 124 aa  149  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  58.26 
 
 		 120 aa  148  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  57.39 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  59.82 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  56.64 
 
 		 120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  53.28 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  55.65 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  54.47 
 
 		 123 aa  144  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  52.5 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  55.17 
 
 		 117 aa  144  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  52.54 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  54.24 
 
 		 123 aa  141  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  52.85 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  54.24 
 
 		 123 aa  141  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  54.7 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  56.64 
 
 		 139 aa  141  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  51.64 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  56.25 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  59.26 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  54.92 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  56.03 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  52.5 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  54.92 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  57.02 
 
 		 122 aa  137  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  59.29 
 
 		 120 aa  136  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  50.43 
 
 		 125 aa  134  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  52.99 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  52.68 
 
 		 125 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  52.73 
 
 		 123 aa  131  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  52.46 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  60.55 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  60.55 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  60.55 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  50 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  56.88 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  54.63 
 
 		 123 aa  121  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  44.25 
 
 		 123 aa  120  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  51.38 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  41.96 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  48.04 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  36.13 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  35.29 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  43.64 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  37.82 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  41.9 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  44.66 
 
 		 170 aa  93.6  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  33.62 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  33.62 
 
 		 120 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  43.27 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  43.69 
 
 		 170 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  43.27 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  43.27 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  43.69 
 
 		 170 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  43.69 
 
 		 170 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  41.9 
 
 		 178 aa  90.5  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  40.95 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  45 
 
 		 110 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  38.83 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  44.86 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  42.72 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  43.93 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  41.75 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  43.88 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  44.79 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2296  thioredoxin  41.18 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2251  Thioredoxin domain protein  36.89 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  47.47 
 
 		 162 aa  84.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  36.73 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  41.18 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  43.3 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  43.88 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  44.83 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  38.61 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  43.14 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  44.44 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  41 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  44.44 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2066  thioredoxin  37.62 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0918718  normal  0.219337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>