More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2714 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  65.89 
 
 
477 aa  650    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  71.46 
 
 
476 aa  716    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  70.61 
 
 
476 aa  681    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  68.43 
 
 
477 aa  671    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  69.04 
 
 
478 aa  676    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
482 aa  985    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  66.88 
 
 
476 aa  653    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  65.05 
 
 
477 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  70.29 
 
 
478 aa  680    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  67.37 
 
 
477 aa  654    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  64.98 
 
 
477 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  68.01 
 
 
477 aa  666    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  65.25 
 
 
481 aa  637    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  63.98 
 
 
480 aa  633  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  63.29 
 
 
505 aa  615  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  65.19 
 
 
477 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  66.04 
 
 
477 aa  609  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  61.97 
 
 
481 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  62.18 
 
 
481 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  62.18 
 
 
481 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  60.67 
 
 
482 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  62.16 
 
 
481 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  62.61 
 
 
481 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  62.82 
 
 
481 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  62.37 
 
 
481 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  62.18 
 
 
481 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  62.39 
 
 
481 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  62.95 
 
 
479 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  62.79 
 
 
480 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.29 
 
 
478 aa  578  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  62.03 
 
 
478 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  60.3 
 
 
479 aa  574  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  61.22 
 
 
480 aa  567  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1026  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  62.24 
 
 
478 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.6 
 
 
475 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.66 
 
 
475 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  55.81 
 
 
475 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  55.39 
 
 
476 aa  535  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.95 
 
 
477 aa  535  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.64 
 
 
478 aa  521  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  50.95 
 
 
485 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  50.95 
 
 
495 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.53 
 
 
478 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  51.36 
 
 
477 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  53.8 
 
 
487 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.95 
 
 
496 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  50.21 
 
 
476 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  51.38 
 
 
478 aa  488  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.69 
 
 
485 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  51.11 
 
 
476 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  49.37 
 
 
477 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  51.17 
 
 
477 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
477 aa  465  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
476 aa  455  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  46.31 
 
 
493 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6851  aldehyde dehydrogenase  48.09 
 
 
485 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.42 
 
 
485 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  44.33 
 
 
478 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2828  Aldehyde Dehydrogenase  45.47 
 
 
483 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2142  Aldehyde Dehydrogenase  42.38 
 
 
486 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
481 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.19 
 
 
483 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.4 
 
 
483 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  41.86 
 
 
484 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.55 
 
 
483 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.55 
 
 
483 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  41.98 
 
 
480 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  43.12 
 
 
485 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.98 
 
 
480 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.28 
 
 
492 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.95 
 
 
480 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3766  aldehyde dehydrogenase  45.03 
 
 
483 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  43.28 
 
 
491 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.62 
 
 
485 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.74 
 
 
489 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.83 
 
 
485 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.76 
 
 
488 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.16 
 
 
480 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.99 
 
 
484 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
484 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
509 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.16 
 
 
480 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
496 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  43.19 
 
 
480 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.34 
 
 
479 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.95 
 
 
480 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.46 
 
 
486 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.74 
 
 
493 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.53 
 
 
500 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
493 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.55 
 
 
500 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.16 
 
 
480 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
483 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.9 
 
 
489 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.83 
 
 
482 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.44 
 
 
490 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.74 
 
 
489 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.83 
 
 
482 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  44.11 
 
 
489 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.8 
 
 
483 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>