More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1219 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
309 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  75.66 
 
 
316 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  74.59 
 
 
309 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  74.59 
 
 
308 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  75.58 
 
 
308 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  74.59 
 
 
308 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  74.42 
 
 
328 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  72.22 
 
 
310 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  73.11 
 
 
317 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  71.15 
 
 
319 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  71.48 
 
 
314 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  70.82 
 
 
314 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  71.61 
 
 
326 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  66.01 
 
 
312 aa  434  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  68.81 
 
 
330 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  66.23 
 
 
312 aa  434  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  68.59 
 
 
316 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  66.23 
 
 
312 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  67.95 
 
 
316 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  65.69 
 
 
313 aa  408  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  63.42 
 
 
302 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  60.8 
 
 
303 aa  398  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  61.67 
 
 
304 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  61.67 
 
 
304 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  62.75 
 
 
308 aa  394  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  60 
 
 
305 aa  391  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  60.8 
 
 
313 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
308 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  57.65 
 
 
308 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  57.52 
 
 
328 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  55.92 
 
 
310 aa  374  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
308 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  57.47 
 
 
308 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  58.5 
 
 
308 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  55.78 
 
 
308 aa  355  5e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  54.07 
 
 
311 aa  338  5e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  53.77 
 
 
311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  53.29 
 
 
331 aa  332  7.000000000000001e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  53.04 
 
 
304 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  53.42 
 
 
309 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 
303 aa  315  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 
302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  51.84 
 
 
300 aa  311  7.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  51.01 
 
 
305 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  52.33 
 
 
309 aa  309  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  51.97 
 
 
307 aa  309  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  51.01 
 
 
305 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0077  ornithine carbamoyltransferase  47.08 
 
 
303 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
355 aa  306  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0046  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.425573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  48.17 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  51.5 
 
 
298 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 
312 aa  299  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 
306 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
307 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  48.31 
 
 
302 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
306 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  50.68 
 
 
303 aa  298  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  48.61 
 
 
305 aa  298  9e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  50.69 
 
 
306 aa  297  1e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
329 aa  296  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  48.5 
 
 
309 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  49.66 
 
 
300 aa  296  4e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 
307 aa  295  5e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
304 aa  295  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  49.32 
 
 
306 aa  295  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  48.15 
 
 
301 aa  295  9e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  48.49 
 
 
314 aa  295  9e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  46.82 
 
 
305 aa  294  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  45.18 
 
 
312 aa  294  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
321 aa  294  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  48.47 
 
 
309 aa  293  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 
309 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 
309 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
306 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 
309 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  46.84 
 
 
309 aa  291  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 
309 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 
309 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
306 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  46.98 
 
 
311 aa  291  9e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  47.81 
 
 
304 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  46.49 
 
 
306 aa  291  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 
315 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 
309 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  46.96 
 
 
301 aa  291  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  46.46 
 
 
303 aa  290  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  46.46 
 
 
303 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 
312 aa  290  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 
316 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  49.49 
 
 
302 aa  290  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 
309 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 
560 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
306 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  46.86 
 
 
312 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 
312 aa  288  7e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>