More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2077 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  100 
 
 
333 aa  636  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2473  monosaccharide-transporting ATPase  55.1 
 
 
330 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  50.47 
 
 
335 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  45.19 
 
 
327 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  45.19 
 
 
327 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  45.19 
 
 
326 aa  252  6e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.55105e-05 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  45.85 
 
 
306 aa  231  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4659  monosaccharide-transporting ATPase  44.55 
 
 
331 aa  226  5e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  42.47 
 
 
306 aa  223  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  46.67 
 
 
327 aa  212  6e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  40.65 
 
 
350 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  41.83 
 
 
311 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.30424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  41.83 
 
 
311 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  41.83 
 
 
311 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  41.83 
 
 
311 aa  209  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  41.5 
 
 
311 aa  208  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  41.5 
 
 
311 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  41.5 
 
 
311 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  41.5 
 
 
311 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  41.56 
 
 
310 aa  208  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  41.5 
 
 
311 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  41.5 
 
 
311 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  42.01 
 
 
309 aa  206  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  41.18 
 
 
311 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.52632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  41.83 
 
 
312 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  40.94 
 
 
322 aa  197  2e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  42.07 
 
 
314 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  41.8 
 
 
330 aa  196  5e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  41.8 
 
 
330 aa  196  5e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  41.8 
 
 
330 aa  196  5e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  6.2023e-05 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  41.72 
 
 
324 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  42.71 
 
 
346 aa  193  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  43.3 
 
 
318 aa  192  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  40.78 
 
 
327 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  40.97 
 
 
327 aa  192  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  42.3 
 
 
310 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  41.38 
 
 
310 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.64 
 
 
310 aa  189  6e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  38.31 
 
 
311 aa  188  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  42.3 
 
 
835 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  43.68 
 
 
358 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.543201 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  40.69 
 
 
321 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  40.69 
 
 
321 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  40.69 
 
 
321 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  40.69 
 
 
321 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  40.69 
 
 
321 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  40.69 
 
 
321 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  40.69 
 
 
321 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  40.69 
 
 
321 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  38.34 
 
 
322 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  41.52 
 
 
323 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  37.95 
 
 
324 aa  186  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  44.41 
 
 
325 aa  186  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  40.38 
 
 
321 aa  185  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  37.62 
 
 
324 aa  184  1e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  33.63 
 
 
331 aa  184  1e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40.28 
 
 
309 aa  184  2e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  38.65 
 
 
322 aa  183  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  40.06 
 
 
321 aa  183  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  40.06 
 
 
321 aa  183  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  40.06 
 
 
321 aa  183  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  40.06 
 
 
321 aa  183  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  40.06 
 
 
321 aa  183  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  40.49 
 
 
336 aa  182  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  39.51 
 
 
322 aa  182  9e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  38.82 
 
 
321 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  7.74907e-07 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  39.55 
 
 
322 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  45.89 
 
 
319 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  39.37 
 
 
334 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  37.2 
 
 
334 aa  180  3e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  39.93 
 
 
313 aa  180  3e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  39.37 
 
 
342 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  40.82 
 
 
332 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  39.87 
 
 
354 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  37.81 
 
 
334 aa  179  5e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  39.37 
 
 
342 aa  179  5e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2907  Monosaccharide-transporting ATPase  45.74 
 
 
323 aa  179  6e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0357751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  38.73 
 
 
332 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  37.7 
 
 
335 aa  179  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  40.14 
 
 
333 aa  178  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  36.09 
 
 
327 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  3.58536e-06 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  43.48 
 
 
308 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  35.69 
 
 
314 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  40.94 
 
 
336 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  40.47 
 
 
339 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  38.22 
 
 
334 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  36.71 
 
 
334 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  36.71 
 
 
334 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  35.87 
 
 
328 aa  176  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  39.4 
 
 
342 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  35.89 
 
 
328 aa  176  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  36.25 
 
 
341 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  36.56 
 
 
328 aa  175  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  37.77 
 
 
332 aa  174  1e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  36.39 
 
 
335 aa  174  2e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  36.86 
 
 
345 aa  174  2e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  36.39 
 
 
335 aa  174  2e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  40.12 
 
 
333 aa  174  2e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  36.51 
 
 
332 aa  173  3e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 
329 aa  173  4e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>