34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5524 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  887    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  61.56 
 
 		 420 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  58.75 
 
 		 424 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  56.76 
 
 		 457 aa  502  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  56.59 
 
 		 459 aa  502  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  56.04 
 
 		 556 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  51.93 
 
 		 555 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  51.66 
 
 		 441 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  49.88 
 
 		 460 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  48.24 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  51.37 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  45.45 
 
 		 733 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  35.68 
 
 		 929 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  31 
 
 		 474 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  30.04 
 
 		 534 aa  203  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  32.2 
 
 		 503 aa  202  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  29.8 
 
 		 525 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  31.99 
 
 		 423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  31.22 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  29.67 
 
 		 505 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  31.7 
 
 		 443 aa  183  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  30.47 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  30.73 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  28.01 
 
 		 561 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  28.01 
 
 		 560 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  30.65 
 
 		 444 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  30.73 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  29.53 
 
 		 444 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  28.38 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  28.57 
 
 		 439 aa  146  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  24.76 
 
 		 396 aa  146  9e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25.51 
 
 		 1967 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  27.82 
 
 		 412 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  38.46 
 
 		 536 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>