159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4816 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4816  transport-associated  100 
 
 		 258 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0416  transport-associated  54.82 
 
 		 224 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0408  transport-associated  54.39 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3875  transport-associated  50.45 
 
 		 214 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0632  transport-associated  56.81 
 
 		 218 aa  214  9e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0273  transport-associated  55.28 
 
 		 221 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1637  transport-associated  55.8 
 
 		 229 aa  208  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0588013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3764  hypothetical protein  53.05 
 
 		 227 aa  198  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.831681  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0628  transport-associated  54.04 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1064  transport-associated protein  49.41 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0393  transport-associated  55.33 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0231244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3263  transport-associated protein  42.12 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369629  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3428  transport-associated  41.63 
 
 		 284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3442  transport-associated  46.07 
 
 		 219 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3146  transporter, putative  43.46 
 
 		 266 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0273  transport-associated  41.67 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0122562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3462  transport-associated  38.2 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2799  transporter, putative  43.32 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00116321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  43.32 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0022  putative phospholipid-binding protein  43.32 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0386174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3817  putative phospholipid-binding protein  43.32 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  43.32 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3575  transport-associated protein  43.18 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.913691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1744  putative phospholipid-binding protein  43.32 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  43.32 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0125  transport-associated  44.59 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0500  transport-associated protein  42.22 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.476678 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2285  transport-associated  47.19 
 
 		 194 aa  145  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2814  transport-associated  45.75 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0292  transport-associated  45.75 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3393  periplasmic or secreted lipoprotein  44.44 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0199  transport-associated protein  43.79 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.89233  unclonable  0.00000000000748386 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3264  putative signal peptide protein  37.6 
 
 		 271 aa  139  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0218  transport-associated  41.82 
 
 		 265 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0204  transport-associated  41.82 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0407  transport-associated  44.12 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0036  transport-associated  38.92 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0240953  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4311  periplasmic phospholipid binding protein  42.94 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3134  transport-associated  37.08 
 
 		 272 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0106  hypothetical protein  48.37 
 
 		 190 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0163837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0194  transport-associated protein  47.62 
 
 		 195 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491972  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2206  transport-associated protein  44.44 
 
 		 195 aa  122  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0032  transport-associated  38.76 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573132  hitchhiker  0.000000102595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0353  periplasmic or secreted lipoprotein  38.51 
 
 		 200 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1322  transport-associated protein  36.36 
 
 		 192 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4687  transport-associated protein  35.36 
 
 		 192 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.314355  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4402  transport-associated  35.71 
 
 		 192 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.148625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3992  transport-associated  35.75 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4102  transport-associated  35.75 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0224  transport-associated  34.5 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.130883  normal  0.197651 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4072  transport-associated  35.75 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4190  transport-associated  35.75 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4116  transport-associated protein  36.6 
 
 		 192 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4526  transport-associated  35.06 
 
 		 192 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3687  transport-associated  34.25 
 
 		 188 aa  98.6  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0258  transport-associated  34.25 
 
 		 188 aa  98.6  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  35.06 
 
 		 192 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3883  transport-associated  34.25 
 
 		 188 aa  98.6  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180812 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3695  transport-associated  34.62 
 
 		 188 aa  98.6  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.904296  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  35.44 
 
 		 161 aa  98.6  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  38.06 
 
 		 192 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  32.45 
 
 		 188 aa  96.3  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0908  transport-associated  34.32 
 
 		 177 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  33.12 
 
 		 192 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57510  putative secreted lipoprotein  33.12 
 
 		 192 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0297  putative lipoprotein  33.7 
 
 		 188 aa  95.1  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4254  transport-associated  33.54 
 
 		 189 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0349  transport-associated protein  32.4 
 
 		 189 aa  93.2  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3627  hypothetical protein  36.36 
 
 		 190 aa  93.2  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0737  hypothetical protein  34.52 
 
 		 195 aa  92  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131598  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  32.96 
 
 		 189 aa  92  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0270  transport-associated  35.06 
 
 		 191 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000691335  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3148  putative lipoprotein  36.18 
 
 		 192 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3357  putative lipoprotein  34.08 
 
 		 188 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0257  lipoprotein  40 
 
 		 191 aa  89.7  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1123  hypothetical protein  35.67 
 
 		 191 aa  89.7  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1936  putative phospholipid-binding liporotein  40 
 
 		 191 aa  89.7  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00720124  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3785  hypothetical protein  35 
 
 		 191 aa  89  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00453791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4435  putative transport protein  32.91 
 
 		 202 aa  89  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0536  hypothetical protein  35.03 
 
 		 191 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0472  hypothetical protein  35.03 
 
 		 191 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0386  transport-associated  31.46 
 
 		 189 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2657  putative lipoprotein  31.58 
 
 		 195 aa  86.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1174  transport-associated  30.05 
 
 		 189 aa  85.1  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382619  normal  0.116131 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004504  putative hemolysin  34.48 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000407403  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03017  hypothetical protein  36.24 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0555  transport-associated  36.24 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3445  hypothetical protein  36 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4469  hypothetical protein  36.24 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3622  hypothetical protein  36 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0548  hypothetical protein  36.24 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.496742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02968  hypothetical protein  36.24 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3342  hypothetical protein  36.24 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3632  hypothetical protein  36.24 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00888  hypothetical protein  33.15 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3622  hypothetical protein  34.9 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3525  hypothetical protein  34.9 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.950572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3456  hypothetical protein  34.9 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3454  hypothetical protein  34.9 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3562  hypothetical protein  34.9 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>