More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0806 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 301 aa  619  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  57 
 
 		 304 aa  353  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  56.33 
 
 		 304 aa  352  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  55.33 
 
 		 316 aa  326  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  50.17 
 
 		 299 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  48.49 
 
 		 297 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  46.82 
 
 		 297 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  47.02 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  48.36 
 
 		 301 aa  299  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  48.68 
 
 		 301 aa  298  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  50.5 
 
 		 296 aa  298  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  49.34 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  48.34 
 
 		 297 aa  292  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  49.17 
 
 		 296 aa  291  6e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  49.17 
 
 		 296 aa  291  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  47.35 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  47.35 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  47.35 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  48 
 
 		 295 aa  288  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  47.18 
 
 		 297 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  47.68 
 
 		 297 aa  288  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  47.68 
 
 		 297 aa  288  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  47.68 
 
 		 297 aa  288  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  47.68 
 
 		 297 aa  288  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  47.35 
 
 		 297 aa  288  8e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  47.68 
 
 		 297 aa  288  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  46.69 
 
 		 297 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  47.35 
 
 		 297 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  46.84 
 
 		 297 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  47.02 
 
 		 297 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  47.74 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  47.35 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  47.02 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  47.02 
 
 		 297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  46.36 
 
 		 297 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  45.85 
 
 		 297 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  46.36 
 
 		 297 aa  281  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  46.36 
 
 		 297 aa  281  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  46.36 
 
 		 297 aa  281  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  46.36 
 
 		 297 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  45.54 
 
 		 297 aa  278  9e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  45.39 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  45.27 
 
 		 294 aa  275  6e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  44.3 
 
 		 307 aa  272  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  46.02 
 
 		 295 aa  265  5.999999999999999e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0468  hypothetical protein  47.37 
 
 		 298 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  43.23 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  44.48 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4710  hypothetical protein  44.85 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  42.9 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1127  hypothetical protein  44.55 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0966  hypothetical protein  43.56 
 
 		 300 aa  244  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.73 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746342  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  40.73 
 
 		 305 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  38.76 
 
 		 307 aa  237  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.86 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  37.46 
 
 		 306 aa  235  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  40.4 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  40.07 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.95 
 
 		 299 aa  232  6e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  41.91 
 
 		 300 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  39.74 
 
 		 301 aa  231  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  40.73 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  40.4 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  39.74 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  39.74 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  41.72 
 
 		 301 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  40.07 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  36.81 
 
 		 306 aa  229  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  38.08 
 
 		 298 aa  228  7e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  40.07 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2375  hypothetical protein  38.12 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  37.95 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2219  hypothetical protein  39.67 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.209038 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  39.67 
 
 		 462 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  38.61 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  37.91 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  38.21 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2461  hypothetical protein  35.98 
 
 		 320 aa  219  7e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.24 
 
 		 307 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610214  normal  0.634966 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0221  hypothetical protein  38.82 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0251  cell division inhibitor  38.82 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.451616  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.53 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0743  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.53 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  36.81 
 
 		 307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  36.81 
 
 		 307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  39.2 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.53 
 
 		 321 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61590  hypothetical protein  39.73 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.138504 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  39.09 
 
 		 313 aa  211  9e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  36.88 
 
 		 499 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  38.39 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  35.92 
 
 		 306 aa  208  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  37.86 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01371  putative cell division inhibitor  38.96 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0269314  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  35.83 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  36.48 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  37.95 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1487  putative cell division inhibitor  38.06 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>