More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06682 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  100 
 
 		 224 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  93.75 
 
 		 224 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  73.66 
 
 		 224 aa  354  6.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  68.3 
 
 		 224 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  68.3 
 
 		 224 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  68.3 
 
 		 224 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  68.75 
 
 		 224 aa  325  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  67.71 
 
 		 225 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  65.32 
 
 		 230 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  64.29 
 
 		 224 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  65.77 
 
 		 245 aa  304  7e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  64.57 
 
 		 226 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  65.32 
 
 		 245 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  64.86 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  63.39 
 
 		 227 aa  298  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  63.23 
 
 		 233 aa  296  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  62.61 
 
 		 238 aa  296  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  61.99 
 
 		 234 aa  292  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  61.43 
 
 		 238 aa  291  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  61.43 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  60.36 
 
 		 225 aa  287  9e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  60.36 
 
 		 225 aa  286  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  60.36 
 
 		 225 aa  286  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  59.91 
 
 		 225 aa  286  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  60.36 
 
 		 225 aa  286  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  60.36 
 
 		 225 aa  286  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  60.81 
 
 		 225 aa  285  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  62.5 
 
 		 226 aa  285  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  59.91 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  59.91 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  59.91 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  59.91 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  59.91 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  59.91 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  59.91 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  59.91 
 
 		 225 aa  280  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  60.09 
 
 		 228 aa  273  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  56.05 
 
 		 229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  57.4 
 
 		 224 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  39.39 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  39.39 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1884  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.56 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  37.27 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  37.27 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.82 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  36.82 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  36.82 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  36.12 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.36 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.68 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  35.91 
 
 		 236 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3750  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.54 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  32.16 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  33.04 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.72 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  32.16 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  31.72 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  31.72 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  33.04 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.16 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  31.09 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  29.96 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  34.63 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  31.28 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.28 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.18 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.3 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.04 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  32.02 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  29.91 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  31.6 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  31.6 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  30.6 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.69 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  33.83 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  33.83 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.57 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.62 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  32.52 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.79 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  30.87 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  30.88 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.39 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.37 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0804  nucleotidase  29.67 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  27.51 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  26.87 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  35.94 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.26 
 
 		 228 aa  85.1  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.07 
 
 		 223 aa  84.7  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  36.07 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.25 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  34.43 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  26.89 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  27.13 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  26.47 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  26.47 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.94 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  33.59 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>