More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1110 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1110  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
517 aa  1059    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1675  glycoside hydrolase family protein  49.31 
 
 
513 aa  482  1e-135  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.256832  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0408  glycoside hydrolase family protein  44.86 
 
 
489 aa  410  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0125143  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
486 aa  389  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000739457  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  40.32 
 
 
467 aa  372  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000340299  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  37.32 
 
 
934 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  36.07 
 
 
885 aa  306  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  30.51 
 
 
418 aa  218  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  27.95 
 
 
432 aa  194  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  31.08 
 
 
417 aa  192  9e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  28.99 
 
 
436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  29.68 
 
 
431 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 
443 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  29.28 
 
 
431 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  28.65 
 
 
450 aa  189  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 
442 aa  177  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  27.79 
 
 
446 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  28.93 
 
 
452 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  27.79 
 
 
446 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  27.05 
 
 
451 aa  169  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  24.18 
 
 
427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  26.77 
 
 
446 aa  167  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  28.79 
 
 
476 aa  167  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  26.92 
 
 
446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  28.44 
 
 
482 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  25.9 
 
 
465 aa  163  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  26.69 
 
 
452 aa  162  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  27.15 
 
 
452 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  26.98 
 
 
470 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 
399 aa  159  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  26.32 
 
 
448 aa  157  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 
413 aa  157  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  25.88 
 
 
452 aa  156  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  28.08 
 
 
478 aa  156  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  25.78 
 
 
439 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  25.44 
 
 
438 aa  155  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 
478 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  26.42 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  26.8 
 
 
447 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  23.87 
 
 
427 aa  154  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  25.61 
 
 
472 aa  154  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  27.07 
 
 
472 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  28.68 
 
 
444 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  27.48 
 
 
474 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  24.9 
 
 
461 aa  151  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  27.09 
 
 
491 aa  150  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  28.38 
 
 
455 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  26.71 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  26.72 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  24.52 
 
 
474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  27.84 
 
 
909 aa  149  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  27.06 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  27.48 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  25.19 
 
 
449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  24.44 
 
 
475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  26.27 
 
 
453 aa  147  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  25.29 
 
 
470 aa  147  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  25.63 
 
 
450 aa  147  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  28.6 
 
 
453 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  25.49 
 
 
443 aa  146  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  25.34 
 
 
489 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  26.93 
 
 
494 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  25.74 
 
 
443 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  26.93 
 
 
479 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  25 
 
 
444 aa  143  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  26.76 
 
 
443 aa  143  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  27.81 
 
 
470 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  26.42 
 
 
459 aa  143  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  26.14 
 
 
440 aa  143  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  23.55 
 
 
467 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  26.91 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  24.76 
 
 
465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  24.9 
 
 
443 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  24.11 
 
 
468 aa  141  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  25.48 
 
 
468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  26.1 
 
 
456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  25.93 
 
 
447 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  25.54 
 
 
470 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  27.45 
 
 
457 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  26.41 
 
 
463 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  26.63 
 
 
439 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  26.54 
 
 
455 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  26.16 
 
 
457 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  27.41 
 
 
467 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  25.63 
 
 
464 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  26.38 
 
 
448 aa  136  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  26.7 
 
 
466 aa  136  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  26.83 
 
 
457 aa  136  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  26.33 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  25.73 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  24.65 
 
 
446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  26.53 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  23.53 
 
 
451 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  25.05 
 
 
463 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  25.83 
 
 
494 aa  135  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  23.12 
 
 
451 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  23.42 
 
 
457 aa  134  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  25.44 
 
 
444 aa  134  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  24.95 
 
 
471 aa  133  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  23.34 
 
 
470 aa  133  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>