55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2268 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  508  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  62.6 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  56.08 
 
 		 254 aa  278  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  49.41 
 
 		 269 aa  205  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  44.57 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  44.23 
 
 		 291 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  43.53 
 
 		 263 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  42.75 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  40.55 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  37.01 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  38.61 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  37.84 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  39.84 
 
 		 288 aa  162  7e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  34.25 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  34.96 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  34.96 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  31.52 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  35.18 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  34.78 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  33.71 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  35.58 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  34.83 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  33.07 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  34.39 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  34.39 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  34.39 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  32.58 
 
 		 276 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  33.21 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  27.86 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  31.27 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  30.65 
 
 		 262 aa  95.5  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  30.08 
 
 		 258 aa  95.5  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  31.01 
 
 		 276 aa  92  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  30 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  31.05 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  28.25 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  27.59 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  27.27 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  30.08 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  30.4 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  25.65 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  30.74 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  28.9 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  28.9 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  28.9 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  25.87 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  29.01 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  28.79 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  25.55 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3942  hypothetical protein  26.47 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  25.1 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  25.1 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  25.1 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  27.61 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4413  hypothetical protein  46 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0436871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>