More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0138 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 486 aa  934    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  72.8 
 
 		 491 aa  663    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  62.32 
 
 		 521 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  59.38 
 
 		 488 aa  549  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.75 
 
 		 498 aa  549  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  63.79 
 
 		 479 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.66 
 
 		 506 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  56.22 
 
 		 481 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.22 
 
 		 470 aa  498  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.72 
 
 		 480 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.67 
 
 		 515 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  53.96 
 
 		 487 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.43 
 
 		 490 aa  479  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.31 
 
 		 491 aa  481  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.93 
 
 		 490 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.22 
 
 		 470 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  52.78 
 
 		 494 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.71 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.71 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.63 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.71 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.84 
 
 		 483 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  50.93 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.72 
 
 		 517 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.3 
 
 		 463 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.75 
 
 		 507 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.01 
 
 		 488 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.94 
 
 		 475 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  52.27 
 
 		 496 aa  432  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.42 
 
 		 461 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  48.28 
 
 		 493 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.23 
 
 		 518 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  50.52 
 
 		 502 aa  424  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.86 
 
 		 484 aa  412  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.88 
 
 		 480 aa  363  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.1 
 
 		 465 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.64 
 
 		 496 aa  333  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.34 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  40.71 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.13 
 
 		 456 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.98 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.01 
 
 		 460 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.97 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.29 
 
 		 442 aa  280  6e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.04 
 
 		 431 aa  279  7e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  35.24 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.47 
 
 		 444 aa  276  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.47 
 
 		 444 aa  276  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.81 
 
 		 440 aa  275  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.64 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.72 
 
 		 442 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.27 
 
 		 433 aa  270  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.03 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.61 
 
 		 429 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0499  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.25 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000767859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0302  xanthine/uracil permease family protein  36.27 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00487612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.05 
 
 		 441 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.25 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  36.05 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  36.05 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  35.84 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  35.84 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  35.84 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  35.84 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  35.84 
 
 		 441 aa  261  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.81 
 
 		 463 aa  260  4e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0254  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.84 
 
 		 441 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000390188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  36.27 
 
 		 441 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1869  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.69 
 
 		 438 aa  256  8e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000010508  hitchhiker  0.00000000167623 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.99 
 
 		 428 aa  253  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.46 
 
 		 454 aa  253  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4183  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.97 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.851751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.97 
 
 		 443 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.68 
 
 		 471 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.14 
 
 		 457 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.62 
 
 		 465 aa  249  7e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  32.56 
 
 		 437 aa  249  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0570  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.59 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.46787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.78 
 
 		 431 aa  247  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1867  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.84 
 
 		 455 aa  247  4e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000230048  hitchhiker  0.00000000132441 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.62 
 
 		 438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.83 
 
 		 453 aa  246  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0172  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.81 
 
 		 451 aa  246  6.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000522834  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.12 
 
 		 443 aa  246  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  32.77 
 
 		 467 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  35.27 
 
 		 431 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.16 
 
 		 446 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  37.39 
 
 		 430 aa  243  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2711  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.68 
 
 		 448 aa  243  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172353  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  35.18 
 
 		 437 aa  243  5e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.75 
 
 		 433 aa  243  6e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.5 
 
 		 446 aa  243  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0414  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.47 
 
 		 482 aa  243  7.999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.222193  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  37.26 
 
 		 430 aa  242  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  35.34 
 
 		 431 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2295  xanthine/uracil/vitamin C transporter  33.97 
 
 		 436 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  35.05 
 
 		 431 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.36 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.19 
 
 		 436 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.41 
 
 		 433 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>