235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1498 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1498  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 125 aa  244  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0402  ribosome-binding factor A  53.6 
 
 		 125 aa  134  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0072  ribosome-binding factor A  47.41 
 
 		 131 aa  120  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0072  ribosome-binding factor A  46.55 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.884445  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1691  ribosome-binding factor A  40.17 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  33.05 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  41.49 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  32.26 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  35.9 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  36.73 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  36.73 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  31.9 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  37.76 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  37.76 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  30.33 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  37.76 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  36.73 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  36.73 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11490  ribosome-binding factor A  31.86 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871158  normal  0.911894 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  35 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  36.73 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0873  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  36.73 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  34.17 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  32.43 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  32.97 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  37.63 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  35.05 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  33.9 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  30.33 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_854  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000358033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  29.41 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  27.36 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  36.61 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  27.59 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  32.76 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1105  ribosome-binding factor A  39.62 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.657587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0226  ribosome-binding factor A  28.83 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0769  ribosome-binding factor A  36.05 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  30.65 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  30.08 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2315  ribosome-binding factor A  36.67 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.665  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  24.19 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  31.62 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2818  ribosome-binding factor A  29.82 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3851  ribosome-binding factor A  31.96 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.258524  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  29.36 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8062  predicted protein  28.68 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00519858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01261  ribosome-binding factor A  29.79 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0310075  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  29.82 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  27.03 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2819  ribosome-binding factor A  29.82 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00171915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3726  ribosome-binding factor A  26.79 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1413  ribosome-binding factor A  27.12 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0070  ribosome-binding factor A  35.87 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.196892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  26.05 
 
 		 119 aa  52  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 140 aa  52  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  31.15 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  28.23 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  29.06 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  29.27 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  27.35 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  26.79 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0075  ribosome-binding factor A  34.78 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.122288  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  27.12 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  32.97 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4619  ribosome-binding factor A  26.13 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2610  ribosome-binding factor A  27.03 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1633  ribosome-binding factor A  28.95 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100642  hitchhiker  0.000771704 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  32.18 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1212  ribosome-binding factor A  26.4 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.316878  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0158  ribosome-binding factor A  35.87 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  27.12 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  27.12 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1748  ribosome-binding factor A  29.2 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0187668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  30.28 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  27.12 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  27.12 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0832  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1869  ribosome-binding factor A  29.75 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  26.09 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 119 aa  50.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  25.62 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3595  ribosome-binding factor A  25.62 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000837981  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  25.62 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  25 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  26.27 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>