252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0832 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0832  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 120 aa  237  5e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1105  ribosome-binding factor A  40.78 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.657587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  39.22 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  34.51 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  39.22 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  39.22 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  32.76 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2773  ribosome-binding factor A  34.19 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  37.25 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  37.25 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  37.62 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  37.86 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  37.25 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  37.25 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  37.89 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  37.25 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  37.25 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  37.25 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  36.75 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  36.75 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  36.27 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  35.35 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  36.89 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  34.04 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  30.7 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  35.23 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  35.35 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  30.84 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  35.64 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_854  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000358033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  33.98 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  37.08 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  35.9 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  33.66 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  26.45 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  35.9 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  32.74 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  28.89 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  29.46 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  33.66 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  33.66 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  37.84 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  33.66 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  31.53 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  33.66 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  32.71 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  30.93 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  30.93 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  35.42 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1060  ribosome-binding factor A  32.38 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00435559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1916  ribosome-binding factor A  32.38 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24329  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0873  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231797  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  31.53 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  31.53 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2563  ribosome-binding factor A  32.38 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  30.53 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0992  ribosome-binding factor A  32.38 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197459  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  29.91 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  34.31 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  32.98 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1383  ribosome-binding factor A  30.48 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1423  ribosome-binding factor A  30.48 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.02264 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1741  ribosome-binding factor A  32.38 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1763  ribosome-binding factor A  32.38 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  36.47 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0174  ribosome-binding factor A  32.38 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0246509  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1506  ribosome-binding factor A  32.38 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  31.31 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  28.45 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  33.91 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  29.2 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01261  ribosome-binding factor A  32.23 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0310075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>