131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1380 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  100 
 
 		 77 aa  152  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  59.15 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  56.45 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  51.81 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  51.52 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  51.47 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  49.32 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  51.61 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  48.19 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  53.85 
 
 		 80 aa  67  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.52 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0701  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.95 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584893  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0725  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.95 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  54.1 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  51.52 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  42.17 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  56.67 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  45.78 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  45.78 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  45.78 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  45.78 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  45.78 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  45.78 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  45.78 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  45.78 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  43.37 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  45.78 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  46.75 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.75 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  42.11 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  42.5 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  45.45 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.24 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.24 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  40 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.78 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  42.35 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.78 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  42.68 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.15 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  43.37 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.75 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  50.82 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  43.55 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  48.33 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.94 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  43.55 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  45.16 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  42.62 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  42.62 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  45.16 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  45.16 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  42.42 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  50.94 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  35.71 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03954  heat shock protein 15  42.42 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  41.94 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  48.98 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  38.71 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4348  hypothetical protein  48.33 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  37.88 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  46.94 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1152  RNA-binding S4  40.98 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  46.94 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  38.71 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  36.36 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  34.85 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.34 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0165  heat shock protein 15  38.78 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  34.72 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.26 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2329  heat shock protein 15  32.26 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3325  heat shock protein 15  32.26 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  30.65 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1649  heat shock protein 15  38.71 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0497  heat shock protein 15  32.26 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.673566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1102  heat shock protein 15  32.26 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3281  heat shock protein 15  32.26 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3314  heat shock protein 15  32.26 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2209  heat shock protein 15  32.26 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3135  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.73 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0250  RNA-binding S4 domain protein  37.5 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0157296 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  37.5 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3977  RNA-binding S4  37.7 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1026  RNA-binding S4 domain protein  42.47 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.319411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.82 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0265  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.664213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.85 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0275  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  34.85 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1265  RNA-binding S4  36.67 
 
 		 131 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0859  RNA-binding S4 domain protein  40.82 
 
 		 132 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0095  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.36 
 
 		 134 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.43 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4962  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 		 133 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  32.26 
 
 		 135 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1769  S4 domain-containing protein  38.46 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00186229  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  33.85 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  32.26 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1704  S4 domain-containing protein  38.46 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000120647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>