More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0483 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0827  GTP-binding protein HSR1-related  54 
 
 		 266 aa  267  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  45.6 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  45.6 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  43.98 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  35.16 
 
 		 323 aa  156  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  35.71 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  33.21 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  34.31 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  34.31 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  33.46 
 
 		 314 aa  152  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  34.31 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  34.31 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  34.31 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  34.31 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  34.31 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  34.31 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  33.93 
 
 		 284 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  33.94 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  33.94 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  35.32 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  34.2 
 
 		 271 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  34.74 
 
 		 312 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  32.12 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  33.09 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  35.14 
 
 		 291 aa  148  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  33.7 
 
 		 318 aa  148  8e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  31.64 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  33.83 
 
 		 312 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  30.07 
 
 		 292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  33.46 
 
 		 314 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  34.2 
 
 		 313 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  37.23 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  33.58 
 
 		 318 aa  145  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  33.58 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  36.46 
 
 		 282 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  32.36 
 
 		 283 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  32.37 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  33.83 
 
 		 313 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  33.83 
 
 		 313 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  33.83 
 
 		 313 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  33.46 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  33.09 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  33.83 
 
 		 313 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  32.71 
 
 		 313 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  32.37 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  33.33 
 
 		 311 aa  142  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  34.07 
 
 		 334 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  32.84 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  32.47 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  32.85 
 
 		 313 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  32.71 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  30.51 
 
 		 319 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  33.57 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  32.13 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  32.13 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  32.13 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  31.87 
 
 		 292 aa  138  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  31.62 
 
 		 284 aa  138  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  32.71 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  32.25 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  32.25 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  29.78 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.4 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  30.48 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  34.6 
 
 		 323 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  32.61 
 
 		 281 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  33.94 
 
 		 280 aa  131  9e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  32.61 
 
 		 281 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  29 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  28.15 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  33.21 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1013  ribosomal biogenesis GTPase  32.73 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  32.98 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  28.99 
 
 		 305 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  29.37 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1416  ribosomal biogenesis GTPase  32.16 
 
 		 283 aa  128  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00443588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  30.51 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.1 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  33.33 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  35.36 
 
 		 374 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  32.23 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  30.66 
 
 		 324 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  31.27 
 
 		 307 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  30.11 
 
 		 307 aa  123  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.89 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  29.52 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  31.23 
 
 		 369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  34.22 
 
 		 388 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  34.01 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  33.84 
 
 		 384 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1227  GTP-binding protein HSR1-related  29.89 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  30.51 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  29.52 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3396  GTP-binding  30.11 
 
 		 330 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  29.74 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  31.05 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  30.66 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  30.85 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  28.57 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>