More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0101 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  100 
 
 
434 aa  848  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  73.71 
 
 
432 aa  571  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  49.08 
 
 
428 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  41.13 
 
 
417 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  36.41 
 
 
445 aa  239  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  37.89 
 
 
434 aa  237  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  36.74 
 
 
432 aa  231  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  34.9 
 
 
434 aa  227  4e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  34.11 
 
 
434 aa  226  6e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 
421 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 
441 aa  204  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  28.4 
 
 
432 aa  186  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  28.4 
 
 
432 aa  185  1e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 
439 aa  183  4e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.53779e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
437 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  29.31 
 
 
430 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  29.79 
 
 
430 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  29.19 
 
 
430 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  29.79 
 
 
430 aa  164  4e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  28.84 
 
 
443 aa  162  9e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  28.84 
 
 
443 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  29.17 
 
 
426 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  27.68 
 
 
426 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  29.82 
 
 
418 aa  155  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  28.83 
 
 
443 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  28.44 
 
 
427 aa  153  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  28.44 
 
 
422 aa  152  9e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  36.01 
 
 
414 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  30.17 
 
 
425 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  30.17 
 
 
425 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  28.6 
 
 
431 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  29.55 
 
 
437 aa  148  1e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  29.55 
 
 
437 aa  149  1e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  29.18 
 
 
417 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
446 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.64401e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  27.95 
 
 
431 aa  142  1e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
425 aa  140  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
415 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  27.01 
 
 
439 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
411 aa  130  5e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  24.87 
 
 
428 aa  130  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  25.64 
 
 
428 aa  129  9e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  27.25 
 
 
366 aa  128  2e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  27.57 
 
 
452 aa  128  2e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
392 aa  127  4e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
421 aa  127  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  26.98 
 
 
366 aa  127  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  27.32 
 
 
452 aa  126  6e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  27.17 
 
 
432 aa  126  8e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 
395 aa  126  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  27.36 
 
 
451 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  26.93 
 
 
434 aa  122  1e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  26.58 
 
 
426 aa  119  1e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  25.37 
 
 
423 aa  118  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  31.52 
 
 
418 aa  116  7e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  25.37 
 
 
423 aa  116  7e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  26.68 
 
 
384 aa  112  1e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  28.01 
 
 
446 aa  112  2e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  28.01 
 
 
446 aa  112  2e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  27.56 
 
 
425 aa  111  2e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  26.58 
 
 
428 aa  112  2e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  26.33 
 
 
428 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.73012e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  25.58 
 
 
418 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  27.5 
 
 
405 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
423 aa  106  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3390  major facilitator transporter  26.79 
 
 
441 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  28.68 
 
 
430 aa  106  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  27.05 
 
 
432 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2985  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 
424 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.124537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  31 
 
 
407 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
439 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  25 
 
 
429 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  26.17 
 
 
427 aa  100  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  30.05 
 
 
446 aa  99.8  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  27.05 
 
 
415 aa  99.8  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  24.87 
 
 
406 aa  99.8  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  28.61 
 
 
412 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  29.28 
 
 
420 aa  97.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  25.55 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
423 aa  97.1  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
420 aa  96.3  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  27.11 
 
 
429 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  29.48 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 
413 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  33.87 
 
 
398 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  26.15 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  27.55 
 
 
442 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 
447 aa  94.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  26.02 
 
 
442 aa  94  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 
411 aa  94.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  26.32 
 
 
418 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  28.77 
 
 
389 aa  94  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  23.52 
 
 
427 aa  93.6  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
426 aa  93.2  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 
429 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  23.52 
 
 
427 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  28.42 
 
 
416 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  26.85 
 
 
420 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
441 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 
395 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>