53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1485 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1485  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  265  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  37.69 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4310  hypothetical protein  37.04 
 
 
131 aa  59.7  1e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  40.4 
 
 
143 aa  57  9e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  33.61 
 
 
138 aa  56.2  1e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  35.37 
 
 
576 aa  52  2e-06  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  36.52 
 
 
138 aa  52  3e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  36.52 
 
 
138 aa  52  3e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  35.83 
 
 
140 aa  52  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  35.65 
 
 
138 aa  50.8  7e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  36.25 
 
 
189 aa  50.1  1e-05  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  27.05 
 
 
130 aa  49.7  2e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  36.25 
 
 
182 aa  48.5  3e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  31.36 
 
 
137 aa  48.5  3e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1359  protein of unknown function DUF35  38.2 
 
 
125 aa  48.1  4e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.488871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  31.03 
 
 
128 aa  48.1  4e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  28.21 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  32.17 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  30.51 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.909625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  24.69 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  25 
 
 
321 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  29.85 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  30.14 
 
 
177 aa  44.3  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  29.37 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  29.37 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  28.21 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  25.95 
 
 
140 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  28.21 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  26.67 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  28.68 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  28.68 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  28.68 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  28.68 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  26.83 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  28.68 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  28.68 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  28.21 
 
 
137 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  28.57 
 
 
178 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  31.82 
 
 
157 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  28.81 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4070  hypothetical protein  26.05 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322816  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  24.14 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  32.23 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  29.91 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.85754e-05  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  28.21 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  30.71 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  28.03 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  32.53 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  30.71 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  30.71 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  24.79 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  30.99 
 
 
146 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  29.57 
 
 
149 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>