71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0444 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  815    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  63.73 
 
 
383 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  57.81 
 
 
398 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  56.33 
 
 
389 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  55.47 
 
 
397 aa  388  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  53.61 
 
 
391 aa  339  4e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  41.41 
 
 
386 aa  236  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  45.59 
 
 
383 aa  233  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  36.59 
 
 
398 aa  232  8.000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  41.69 
 
 
385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  35.54 
 
 
404 aa  213  5.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  33.68 
 
 
396 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  35.47 
 
 
406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  35.42 
 
 
401 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4241  domain of unknown function DUF1745  32.45 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  hitchhiker  0.00000452646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4078  domain of unknown function DUF1745  36.59 
 
 
411 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  33.83 
 
 
398 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  31.86 
 
 
414 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  31.78 
 
 
414 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  31.78 
 
 
414 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0281  hypothetical protein  35.56 
 
 
431 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.812324  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24381  hypothetical protein  27.47 
 
 
429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2063  hypothetical protein  29.1 
 
 
425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.748308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  28.08 
 
 
396 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  26.7 
 
 
396 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  27.42 
 
 
396 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  29.38 
 
 
374 aa  103  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  26.7 
 
 
396 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  25.98 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  31.8 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  32.58 
 
 
398 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  27.91 
 
 
378 aa  90.1  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  27.91 
 
 
378 aa  90.1  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3261  hypothetical protein  33.19 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.389498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  28.72 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  30.8 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0306  hypothetical protein  31.09 
 
 
447 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3887  hypothetical protein  29.58 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.894307 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  27.14 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3160  domain of unknown function DUF1745  29.58 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  27.09 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  29.73 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  30.13 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0622  hypothetical protein  27.31 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4508  hypothetical protein  28.63 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  31.45 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0750  domain of unknown function DUF1745  27.24 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29005  predicted protein  25.99 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161534  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0450  hypothetical protein  28.88 
 
 
430 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2266  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  24.7 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  25.13 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4934  hypothetical protein  26.97 
 
 
422 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  26.45 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  33.62 
 
 
395 aa  63.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  25.1 
 
 
379 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1154  hypothetical protein  26.95 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  25.74 
 
 
806 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  24.76 
 
 
400 aa  53.5  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  30.34 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  26.89 
 
 
379 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  19.89 
 
 
933 aa  51.2  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  27.98 
 
 
1101 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  27.24 
 
 
400 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  25.91 
 
 
408 aa  46.6  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  33.33 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0852  hypothetical protein  24.03 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.214609  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0996  hypothetical protein  24.03 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0343118  normal  0.112953 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  26.86 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  23.81 
 
 
406 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  30.46 
 
 
1852 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  24.9 
 
 
417 aa  43.1  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>