149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1325 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1325  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  249  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0175884  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  46.83 
 
 
136 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  43.65 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  42.74 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  42.06 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  38.71 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  38.71 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  40.8 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  42.4 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  37.9 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  37.9 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  42.4 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  38.71 
 
 
140 aa  94.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  39.52 
 
 
140 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  37.1 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  37.1 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  37.8 
 
 
140 aa  90.1  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  43.65 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  41.73 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1248  hypothetical protein  42.86 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3804  hypothetical protein  39.23 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000216317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0281  hypothetical protein  45.67 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440714  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1215  hypothetical protein  39.52 
 
 
140 aa  86.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  38.89 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  40.8 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2969  hypothetical protein  42.06 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2425  transmembrane protein  42.06 
 
 
137 aa  84.3  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2449  hypothetical protein  40.8 
 
 
140 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.906177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3446  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0366  hypothetical protein  40.8 
 
 
147 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1225  hypothetical protein  40.8 
 
 
147 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3411  hypothetical protein  40.8 
 
 
138 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3446  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2636  hypothetical protein  40.8 
 
 
138 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  41.27 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  37.8 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0328  hypothetical protein  39.06 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.038975 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0381  hypothetical protein  40.48 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.314635  normal  0.174306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  40.5 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4925  hypothetical protein  41.41 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000715814  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  35.71 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0193  hypothetical protein  40.16 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115967  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0268  hypothetical protein  40.31 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000476461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0263  hypothetical protein  40.31 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0112116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  38.1 
 
 
178 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  36.92 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0236  hypothetical protein  39.84 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  34.65 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  38.89 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  36.51 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  35.61 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  38.58 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  38.1 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  37.6 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  35.25 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  40.94 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  38.1 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  37.3 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  37.3 
 
 
178 aa  73.9  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  36.51 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  39.68 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01813  hypothetical protein  36.92 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0118637  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  36.51 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  36.51 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  36.8 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  33.86 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  37.3 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  36 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  36.36 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  41.73 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  41.73 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  33.07 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  33.07 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  36 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  33.07 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  34.65 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  37.6 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  33.59 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0745  flagellin  31.75 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0307  putative transmembrane protein  39.37 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  33.59 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  38.1 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  32.59 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0628  hypothetical protein  34.92 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000401356  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  34.4 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0151  hypothetical protein  40.91 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  33.07 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  32 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  37.6 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0172  hypothetical protein  40.15 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.445067  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  37.3 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  36 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  34.92 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  37.6 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>