260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0363 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0363  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  100 
 
 
216 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2993  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  51.63 
 
 
213 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.047465  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.63 
 
 
214 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2642  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  48.79 
 
 
212 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0628  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.42 
 
 
218 aa  204  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0778  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.42 
 
 
218 aa  204  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  49.28 
 
 
215 aa  201  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.6 
 
 
213 aa  201  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.01 
 
 
217 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85169  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.86 
 
 
212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.6 
 
 
213 aa  198  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.93 
 
 
210 aa  198  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.45 
 
 
214 aa  197  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.23 
 
 
211 aa  195  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.41 
 
 
214 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.41 
 
 
214 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000023808  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.41 
 
 
214 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.41 
 
 
214 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2153  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.07 
 
 
225 aa  193  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.93 
 
 
214 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.93 
 
 
214 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.54 
 
 
212 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.54 
 
 
212 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.93 
 
 
214 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.41 
 
 
265 aa  192  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000096585  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2817  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.38 
 
 
211 aa  192  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  47.62 
 
 
215 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.01 
 
 
211 aa  190  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.89 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.93 
 
 
212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.89 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.89 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.71 
 
 
212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.89 
 
 
214 aa  188  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.67 
 
 
215 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.12 
 
 
215 aa  187  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.93 
 
 
213 aa  187  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.87 
 
 
218 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2606  pyridoxal 5'-phosphate synthase  46.89 
 
 
213 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.397088  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11923  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.19 
 
 
213 aa  187  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.27 
 
 
214 aa  186  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.44 
 
 
213 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.93 
 
 
229 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001014  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.19 
 
 
211 aa  185  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.7 
 
 
214 aa  185  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000729179 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29241  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.66 
 
 
222 aa  184  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.93 
 
 
214 aa  184  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0767  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.41 
 
 
212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0787  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.89 
 
 
212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.222265 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0417  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.93 
 
 
213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.71 
 
 
211 aa  182  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.41 
 
 
212 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1702  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.19 
 
 
212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.48 
 
 
214 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07092  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.71 
 
 
211 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.31 
 
 
211 aa  181  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.75 
 
 
217 aa  181  7e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.48 
 
 
214 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.27 
 
 
211 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2662  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.75 
 
 
227 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0604494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3489  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.91 
 
 
214 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.481543  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2378  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.27 
 
 
227 aa  179  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.5 
 
 
215 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.5 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_002950  PG1714  pyridoxamine-phosphate oxidase  42.79 
 
 
214 aa  178  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01070  pyridoxamine-phosphate oxidase, putative  40.87 
 
 
268 aa  179  4e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1693  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.71 
 
 
233 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0861149  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2477  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  41.83 
 
 
212 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00062859  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1243  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.23 
 
 
213 aa  178  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0527508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.55 
 
 
215 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.08 
 
 
231 aa  178  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2060  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.98 
 
 
213 aa  178  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0886  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  42.47 
 
 
214 aa  178  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01608  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.71 
 
 
218 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2002  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.71 
 
 
218 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000269962  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.02 
 
 
215 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1763  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.19 
 
 
212 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0024682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01598  hypothetical protein  44.71 
 
 
218 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1807  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.19 
 
 
212 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.413512  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3147  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.71 
 
 
213 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0321619  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1714  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.71 
 
 
218 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1991  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.71 
 
 
218 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1006  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  43 
 
 
217 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1770  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.19 
 
 
212 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2515  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.19 
 
 
212 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.961854  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.55 
 
 
215 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.23 
 
 
218 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0623202  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1561  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.23 
 
 
218 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.67 
 
 
212 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1772  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.23 
 
 
217 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.382068  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1881  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.93 
 
 
217 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.23 
 
 
217 aa  175  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185253  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  46.45 
 
 
215 aa  175  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.23 
 
 
218 aa  175  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000320957  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1726  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  43.75 
 
 
232 aa  175  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1634  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.19 
 
 
212 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420266  normal  0.0379481 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.23 
 
 
212 aa  175  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985992  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1880  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.23 
 
 
240 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.863598  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1830  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  44.23 
 
 
218 aa  175  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  45.19 
 
 
212 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>