87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0017 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0017  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  352  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  45.28 
 
 
224 aa  134  1e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  44.74 
 
 
171 aa  132  2e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  38.95 
 
 
176 aa  131  4e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  36.78 
 
 
178 aa  132  4e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3471  hypothetical protein  52.83 
 
 
197 aa  130  1e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal  0.0531544 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30420  hypothetical protein  45.62 
 
 
199 aa  128  4e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.711369  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  42.26 
 
 
177 aa  127  1e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  44.23 
 
 
191 aa  126  2e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  40.79 
 
 
177 aa  124  8e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  38.86 
 
 
191 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  38.86 
 
 
191 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  41.18 
 
 
185 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3408  hypothetical protein  49.69 
 
 
307 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  38.6 
 
 
192 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  40.82 
 
 
186 aa  121  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  38.86 
 
 
190 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4341  hypothetical protein  42.2 
 
 
178 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.127657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4634  hypothetical protein  42.2 
 
 
178 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4255  hypothetical protein  42.2 
 
 
178 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30650  hypothetical protein  41.81 
 
 
196 aa  121  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  43.1 
 
 
176 aa  120  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  38.01 
 
 
192 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  44.17 
 
 
195 aa  119  2e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  37.43 
 
 
194 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1437  hypothetical protein  44.12 
 
 
224 aa  117  8e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1426  protein of unknown function DUF1130  46.24 
 
 
184 aa  117  1e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000439309  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  38.96 
 
 
198 aa  117  1e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  36.84 
 
 
194 aa  115  2e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  36.84 
 
 
194 aa  115  2e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  39.74 
 
 
182 aa  114  7e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  36.84 
 
 
178 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3555  protein of unknown function DUF1130  49.69 
 
 
176 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  37.43 
 
 
177 aa  111  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  38.46 
 
 
180 aa  111  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  45.45 
 
 
181 aa  111  7e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  36.57 
 
 
180 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2160  hypothetical protein  40.59 
 
 
169 aa  104  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  39.55 
 
 
183 aa  103  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  38.98 
 
 
183 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3491  protein of unknown function DUF1130  44.03 
 
 
176 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3801  hypothetical protein  45.21 
 
 
154 aa  97.4  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  36.77 
 
 
198 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2774  hypothetical protein  35.95 
 
 
209 aa  84  1e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  6.70042e-10  unclonable  1.53517e-07 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  36.48 
 
 
351 aa  82.4  3e-15  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  33.83 
 
 
160 aa  79  3e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1898  hypothetical protein  40.54 
 
 
149 aa  77.4  1e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0934802  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  36.55 
 
 
154 aa  75.5  4e-13  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0317  hypothetical protein  42.27 
 
 
102 aa  75.1  5e-13  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  1.91328e-11  decreased coverage  0.00259322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  37.25 
 
 
195 aa  74.7  6e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  36.81 
 
 
167 aa  74.3  8e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  32.45 
 
 
199 aa  73.6  1e-12  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  2.71396e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0626  protein of unknown function DUF1130  29.05 
 
 
194 aa  73.9  1e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3108  hypothetical protein  42.86 
 
 
106 aa  73.6  2e-12  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0971254  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  30.56 
 
 
284 aa  72.4  3e-12  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0743  hypothetical protein  37.23 
 
 
319 aa  70.1  1e-11  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  36.42 
 
 
153 aa  70.9  1e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  35.62 
 
 
154 aa  68.2  6e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  35.81 
 
 
151 aa  67  1e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  40.15 
 
 
143 aa  66.6  2e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  26.92 
 
 
148 aa  65.5  4e-10  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2268  hypothetical protein  34.69 
 
 
162 aa  65.5  4e-10  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  35.33 
 
 
153 aa  63.9  1e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4240  hypothetical protein  35.51 
 
 
151 aa  62  4e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0072533  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  26.9 
 
 
298 aa  61.6  5e-09  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1460  hypothetical protein  34.9 
 
 
173 aa  60.5  1e-08  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  34.69 
 
 
166 aa  60.1  2e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3308  protein of unknown function DUF1130  40.62 
 
 
68 aa  57  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  0.526797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  31.11 
 
 
148 aa  57  1e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0516  hypothetical protein  37.27 
 
 
176 aa  55.5  4e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597563  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2775  hypothetical protein  29.37 
 
 
159 aa  55.5  4e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4371  protein of unknown function DUF1130  34.48 
 
 
150 aa  55.5  4e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.201417 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1069  hypothetical protein  20.55 
 
 
204 aa  54.7  6e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  1.04806e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1257  hypothetical protein  21.23 
 
 
204 aa  54.7  6e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  4.44267e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  36.24 
 
 
147 aa  52.8  2e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0654  protein of unknown function DUF1130  24.83 
 
 
208 aa  52.4  3e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4268  protein of unknown function DUF1130  34.27 
 
 
150 aa  52.8  3e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3900  hypothetical protein  33.57 
 
 
150 aa  51.6  5e-06  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0922  hypothetical protein  30.23 
 
 
155 aa  51.6  6e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4723  protein of unknown function DUF1130  30.26 
 
 
157 aa  50.8  9e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264076  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6081  protein of unknown function DUF1130  34.48 
 
 
147 aa  50.8  1e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  34.01 
 
 
147 aa  50.4  1e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  27.74 
 
 
297 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0758  hypothetical protein  28.38 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.223342  normal  0.212475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2617  protein of unknown function DUF1130  31.62 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.727406  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0773  protein of unknown function DUF1130  26.12 
 
 
294 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3400  hypothetical protein  30.67 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000709741  normal  0.10054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>