63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0922 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0922  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4723  protein of unknown function DUF1130  85.71 
 
 
157 aa  268  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2775  hypothetical protein  42.86 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  44.59 
 
 
154 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4240  hypothetical protein  42.22 
 
 
151 aa  103  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0072533  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  39.85 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  39.85 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  37.68 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  39.55 
 
 
167 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  42.25 
 
 
148 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1898  hypothetical protein  41.54 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0934802  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  40.69 
 
 
143 aa  87.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  37.67 
 
 
151 aa  87.4  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  42.75 
 
 
147 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2617  protein of unknown function DUF1130  40.14 
 
 
146 aa  84.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.727406  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  39.84 
 
 
160 aa  84  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4268  protein of unknown function DUF1130  43.51 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3900  hypothetical protein  41.98 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  36.22 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4371  protein of unknown function DUF1130  43.18 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.201417 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  30.94 
 
 
284 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  41.98 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6081  protein of unknown function DUF1130  44.27 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  34.38 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0773  protein of unknown function DUF1130  33.08 
 
 
294 aa  67.4  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0516  hypothetical protein  40.6 
 
 
176 aa  67  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  32.31 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  28.46 
 
 
298 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  30.66 
 
 
198 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  31.65 
 
 
177 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  28.68 
 
 
224 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  30.61 
 
 
177 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  27.59 
 
 
191 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  32.35 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  32.35 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  28.68 
 
 
190 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  29.5 
 
 
182 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  26.45 
 
 
195 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  31.06 
 
 
351 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  26.12 
 
 
177 aa  50.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3471  hypothetical protein  30.5 
 
 
197 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal  0.0531544 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  31.79 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  27.27 
 
 
176 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  31.39 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  30.15 
 
 
198 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  24.26 
 
 
178 aa  47.8  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  30.66 
 
 
180 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  31.13 
 
 
183 aa  47.4  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  29.1 
 
 
178 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  29.5 
 
 
195 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30420  hypothetical protein  27.03 
 
 
199 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.711369  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1029  hypothetical protein  28.03 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14565  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0955  hypothetical protein  26.71 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2774  hypothetical protein  28.87 
 
 
209 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670042  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  30 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  29.79 
 
 
192 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3400  hypothetical protein  29.81 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000709741  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  28.06 
 
 
192 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  22.97 
 
 
199 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  24.03 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  27.59 
 
 
181 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1743  protein of unknown function DUF1130  22.76 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0758  hypothetical protein  26.53 
 
 
140 aa  41.6  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.223342  normal  0.212475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>