91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1643 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  314  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  81.82 
 
 		 153 aa  259  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  75.5 
 
 		 166 aa  241  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  72.3 
 
 		 153 aa  230  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  55.86 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  51.05 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  50.78 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  47.18 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  48.85 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  45.83 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1898  hypothetical protein  44.9 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0934802  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  44.83 
 
 		 147 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4268  protein of unknown function DUF1130  43.66 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4371  protein of unknown function DUF1130  44.37 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3900  hypothetical protein  45.07 
 
 		 150 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0516  hypothetical protein  47.55 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6081  protein of unknown function DUF1130  44.52 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0922  hypothetical protein  39.85 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  36.36 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4723  protein of unknown function DUF1130  37.59 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2617  protein of unknown function DUF1130  39.55 
 
 		 146 aa  84.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.727406  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  34.27 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  28.97 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3471  hypothetical protein  35.17 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal  0.0531544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  31.79 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  31.91 
 
 		 297 aa  74.7  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4240  hypothetical protein  35.07 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0072533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0773  protein of unknown function DUF1130  33.33 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2775  hypothetical protein  30.94 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  29.66 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  32.41 
 
 		 351 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30420  hypothetical protein  30.72 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.711369  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  32.41 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  29.37 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3408  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  31.79 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  29.2 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  29.73 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  27.97 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  29.33 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  29.41 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3555  protein of unknown function DUF1130  32.64 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1426  protein of unknown function DUF1130  33.77 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000439309  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3400  hypothetical protein  30.38 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000709741  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  27.92 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  30.99 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  28.47 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  28.47 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  22.38 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0017  hypothetical protein  34.25 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0124  hypothetical protein  32.33 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  28.86 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  26.17 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1743  protein of unknown function DUF1130  28.67 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0743  hypothetical protein  35.29 
 
 		 319 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2268  hypothetical protein  32.17 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  29.93 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  29.14 
 
 		 199 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1029  hypothetical protein  26.57 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14565  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2773  hypothetical protein  31.58 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000099126  unclonable  0.000000140227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  29.25 
 
 		 176 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  26.14 
 
 		 194 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0626  protein of unknown function DUF1130  26.03 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  26.14 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  26.14 
 
 		 194 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  25.74 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4255  hypothetical protein  30.46 
 
 		 178 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4634  hypothetical protein  30.46 
 
 		 178 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4341  hypothetical protein  30.46 
 
 		 178 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.127657 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  26.17 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  25.49 
 
 		 198 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  26.17 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  25.49 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1437  hypothetical protein  27.63 
 
 		 224 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  28.95 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3344  protein of unknown function DUF1130  26.45 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1460  hypothetical protein  28.29 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0317  hypothetical protein  31 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000191328  decreased coverage  0.00259322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  26.49 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  24.84 
 
 		 192 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1023  protein of unknown function DUF1130  31.3 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1069  hypothetical protein  18.49 
 
 		 204 aa  47.4  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000104806  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0781  hypothetical protein  26.62 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.588126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1257  hypothetical protein  19.18 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000444267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3491  protein of unknown function DUF1130  30.56 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4463  hypothetical protein  25.9 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3801  hypothetical protein  32.54 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2774  hypothetical protein  28.97 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670042  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30650  hypothetical protein  25.64 
 
 		 196 aa  41.2  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  27.78 
 
 		 195 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2843  hypothetical protein  24.2 
 
 		 160 aa  40.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000164273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>