77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4371 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4371  protein of unknown function DUF1130  100 
 
 
150 aa  295  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.201417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4268  protein of unknown function DUF1130  92 
 
 
150 aa  253  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3900  hypothetical protein  91.33 
 
 
150 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  78.91 
 
 
147 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  70.55 
 
 
147 aa  183  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6081  protein of unknown function DUF1130  71.23 
 
 
147 aa  168  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  47.59 
 
 
167 aa  134  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  50.67 
 
 
143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  51.49 
 
 
151 aa  120  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  51.09 
 
 
166 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  48.95 
 
 
154 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1898  hypothetical protein  48.95 
 
 
149 aa  117  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0934802  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  47.55 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  43.97 
 
 
153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  45.8 
 
 
154 aa  103  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  46.48 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0922  hypothetical protein  43.18 
 
 
155 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4240  hypothetical protein  41.22 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0072533  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4723  protein of unknown function DUF1130  43.18 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264076  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0516  hypothetical protein  45.26 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597563  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  38.46 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  33.57 
 
 
284 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  35.37 
 
 
351 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2617  protein of unknown function DUF1130  42.18 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.727406  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  29.85 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  37.41 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  30.92 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2775  hypothetical protein  33.83 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0773  protein of unknown function DUF1130  36.36 
 
 
294 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  36.03 
 
 
297 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1460  hypothetical protein  35.53 
 
 
173 aa  67  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  30.61 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  31.25 
 
 
186 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  31.33 
 
 
180 aa  62  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  35.1 
 
 
198 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  28.08 
 
 
177 aa  60.1  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  30.97 
 
 
191 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  29.73 
 
 
178 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  30.97 
 
 
191 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1023  protein of unknown function DUF1130  36.29 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  30.22 
 
 
177 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  31.08 
 
 
192 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2268  hypothetical protein  29.33 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124459 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  32.21 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  28.29 
 
 
192 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  29.61 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3400  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000709741  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  28.95 
 
 
194 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  28.95 
 
 
194 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  28.95 
 
 
194 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  25 
 
 
178 aa  53.9  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  27.15 
 
 
198 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  27.7 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  28.19 
 
 
191 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3471  hypothetical protein  32.67 
 
 
197 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal  0.0531544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  30.61 
 
 
195 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  30.2 
 
 
180 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3408  hypothetical protein  34.35 
 
 
307 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0743  hypothetical protein  28.1 
 
 
319 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  21.83 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0955  hypothetical protein  32.87 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  27.7 
 
 
176 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0017  hypothetical protein  34.21 
 
 
177 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  29.86 
 
 
181 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1029  hypothetical protein  31.58 
 
 
150 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14565  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2843  hypothetical protein  25 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000164273  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0781  hypothetical protein  28.67 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.588126  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  32.86 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  24.83 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  27.21 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1743  protein of unknown function DUF1130  29.37 
 
 
144 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0124  hypothetical protein  31.11 
 
 
146 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  26.47 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0626  protein of unknown function DUF1130  24.65 
 
 
194 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4255  hypothetical protein  30.88 
 
 
178 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4634  hypothetical protein  30.88 
 
 
178 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4341  hypothetical protein  30.88 
 
 
178 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.127657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>