44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1743 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1743  protein of unknown function DUF1130  100 
 
 		 144 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0955  hypothetical protein  54.86 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2773  hypothetical protein  53.85 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000099126  unclonable  0.000000140227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1029  hypothetical protein  59.09 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14565  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0124  hypothetical protein  49.66 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4463  hypothetical protein  45.52 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0781  hypothetical protein  44.14 
 
 		 153 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.588126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  33.81 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1282  hypothetical protein  37.11 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00265789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  29.45 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  30.2 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  28.08 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  29.71 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4240  hypothetical protein  30.08 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0072533  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  28.67 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  29.2 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  27.54 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  27.66 
 
 		 153 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  28.79 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  27.52 
 
 		 284 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  27.94 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  24.29 
 
 		 181 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2617  protein of unknown function DUF1130  28.77 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.727406  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  27.94 
 
 		 177 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0516  hypothetical protein  25.18 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597563  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  29.85 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3400  hypothetical protein  28.12 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000709741  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1898  hypothetical protein  27.46 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0934802  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  24.46 
 
 		 351 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4268  protein of unknown function DUF1130  29.37 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2843  hypothetical protein  26.25 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000164273  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  21.64 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3900  hypothetical protein  29.37 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  26.03 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  25.93 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  27.69 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  23.36 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  24.46 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2775  hypothetical protein  23.02 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4723  protein of unknown function DUF1130  24.83 
 
 		 157 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264076  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6081  protein of unknown function DUF1130  27.48 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0922  hypothetical protein  22.76 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  24.11 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  25.68 
 
 		 199 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>