27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4463 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4463  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  317  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333038  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0781  hypothetical protein  91.5 
 
 
153 aa  296  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.588126  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0124  hypothetical protein  61.38 
 
 
146 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2773  hypothetical protein  53.85 
 
 
146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000099126  unclonable  0.000000140227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1029  hypothetical protein  47.97 
 
 
150 aa  157  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14565  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0955  hypothetical protein  46.81 
 
 
144 aa  142  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1743  protein of unknown function DUF1130  45.52 
 
 
144 aa  136  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1282  hypothetical protein  38.95 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00265789  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  27.34 
 
 
297 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  26.24 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  26.09 
 
 
298 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  28.17 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  25.9 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  27.81 
 
 
180 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  27.7 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  30.26 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0516  hypothetical protein  28.67 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597563  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  27.5 
 
 
194 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  27.5 
 
 
194 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  28.68 
 
 
284 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  25.64 
 
 
199 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  27.5 
 
 
194 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  27.67 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  27.21 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0773  protein of unknown function DUF1130  25.18 
 
 
294 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  27.74 
 
 
167 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  28.87 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>