84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4905 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  97.42 
 
 
194 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  88.24 
 
 
192 aa  342  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  83.84 
 
 
198 aa  337  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  84.97 
 
 
192 aa  337  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  80.1 
 
 
191 aa  317  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  80.1 
 
 
191 aa  317  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  76.4 
 
 
185 aa  285  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  66.86 
 
 
178 aa  258  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  65.9 
 
 
180 aa  250  8.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  60.67 
 
 
182 aa  228  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  56.57 
 
 
177 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  56.5 
 
 
177 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  58.86 
 
 
180 aa  208  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  49.47 
 
 
195 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  52.91 
 
 
183 aa  175  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  52.33 
 
 
183 aa  174  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  46.07 
 
 
190 aa  158  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  47.97 
 
 
191 aa  143  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  46.47 
 
 
178 aa  142  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  42.77 
 
 
186 aa  141  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  41.62 
 
 
171 aa  137  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  45.56 
 
 
224 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  43.1 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3471  hypothetical protein  43.6 
 
 
197 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal  0.0531544 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3408  hypothetical protein  44.91 
 
 
307 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  41.76 
 
 
177 aa  124  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3555  protein of unknown function DUF1130  45.28 
 
 
176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3491  protein of unknown function DUF1130  46.54 
 
 
176 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4634  hypothetical protein  36.16 
 
 
178 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4341  hypothetical protein  36.16 
 
 
178 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.127657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4255  hypothetical protein  36.16 
 
 
178 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1426  protein of unknown function DUF1130  34.57 
 
 
184 aa  108  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000439309  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  36.21 
 
 
176 aa  104  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1437  hypothetical protein  37.5 
 
 
224 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  36 
 
 
176 aa  100  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30650  hypothetical protein  33.71 
 
 
196 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0017  hypothetical protein  36.26 
 
 
177 aa  99.8  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30420  hypothetical protein  34.01 
 
 
199 aa  87.8  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.711369  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2160  hypothetical protein  35.12 
 
 
169 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  37.42 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3108  hypothetical protein  46.67 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0971254  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3801  hypothetical protein  34.44 
 
 
154 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  32.47 
 
 
351 aa  74.7  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2774  hypothetical protein  34.87 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670042  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0317  hypothetical protein  40.21 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000191328  decreased coverage  0.00259322 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  28.57 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  29.41 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  30.07 
 
 
148 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0626  protein of unknown function DUF1130  28.95 
 
 
194 aa  60.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0743  hypothetical protein  33.33 
 
 
319 aa  59.7  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1069  hypothetical protein  28.29 
 
 
204 aa  58.5  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000104806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  29.37 
 
 
148 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2268  hypothetical protein  32.21 
 
 
162 aa  57.4  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124459 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  29.8 
 
 
160 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1257  hypothetical protein  26.97 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000444267  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3308  protein of unknown function DUF1130  45.9 
 
 
68 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  0.526797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  30.3 
 
 
284 aa  56.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  30.15 
 
 
154 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0654  protein of unknown function DUF1130  29.1 
 
 
208 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2775  hypothetical protein  27.56 
 
 
159 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  29.03 
 
 
153 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4240  hypothetical protein  27.86 
 
 
151 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0072533  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  26.14 
 
 
154 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  25 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  27.7 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1460  hypothetical protein  29.41 
 
 
173 aa  48.9  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4371  protein of unknown function DUF1130  27.63 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.201417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2617  protein of unknown function DUF1130  27.27 
 
 
146 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.727406  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6081  protein of unknown function DUF1130  28 
 
 
147 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0773  protein of unknown function DUF1130  25.78 
 
 
294 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0781  hypothetical protein  30 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.588126  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  30.2 
 
 
143 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  29.77 
 
 
297 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3900  hypothetical protein  30.2 
 
 
150 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  26.03 
 
 
298 aa  45.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4268  protein of unknown function DUF1130  30.2 
 
 
150 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  29.33 
 
 
147 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  27.34 
 
 
153 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  25.53 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  26.62 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4723  protein of unknown function DUF1130  29.29 
 
 
157 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264076  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4463  hypothetical protein  27.5 
 
 
153 aa  42  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333038  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>