42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0955 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0955  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  298  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1743  protein of unknown function DUF1130  54.86 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2773  hypothetical protein  52.48 
 
 
146 aa  152  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000099126  unclonable  0.000000140227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1029  hypothetical protein  48.28 
 
 
150 aa  152  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14565  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0124  hypothetical protein  48.28 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0781  hypothetical protein  48.23 
 
 
153 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.588126  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4463  hypothetical protein  46.81 
 
 
153 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333038  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1282  hypothetical protein  36.03 
 
 
140 aa  84  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00265789  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  31.33 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  31.47 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  30.87 
 
 
297 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2843  hypothetical protein  28.3 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000164273  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  30.82 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2617  protein of unknown function DUF1130  32.41 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.727406  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  28.19 
 
 
284 aa  50.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0516  hypothetical protein  31.88 
 
 
176 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  29.93 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  28.68 
 
 
351 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  31.54 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  29.71 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4371  protein of unknown function DUF1130  32.35 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.201417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4723  protein of unknown function DUF1130  26.71 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3400  hypothetical protein  30.57 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000709741  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  29.17 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0922  hypothetical protein  26.71 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  32.62 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  26.09 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  30.15 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6081  protein of unknown function DUF1130  33.58 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  27.27 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4268  protein of unknown function DUF1130  28.95 
 
 
150 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3900  hypothetical protein  28.19 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0332  hypothetical protein  34.09 
 
 
421 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  27.33 
 
 
185 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  27.08 
 
 
194 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0773  protein of unknown function DUF1130  28.03 
 
 
294 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  27.78 
 
 
191 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  27.78 
 
 
191 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  27.08 
 
 
194 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  27.86 
 
 
192 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4240  hypothetical protein  29.1 
 
 
151 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0072533  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  27.08 
 
 
194 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>