34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2773 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2773  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  303  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000099126  unclonable  0.000000140227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1029  hypothetical protein  57.64 
 
 
150 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14565  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0124  hypothetical protein  54.17 
 
 
146 aa  166  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1743  protein of unknown function DUF1130  53.85 
 
 
144 aa  165  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4463  hypothetical protein  53.85 
 
 
153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333038  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0781  hypothetical protein  53.15 
 
 
153 aa  160  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.588126  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0955  hypothetical protein  52.48 
 
 
144 aa  152  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1282  hypothetical protein  37.96 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00265789  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  32.14 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  32.39 
 
 
166 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0516  hypothetical protein  34.25 
 
 
176 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  31.3 
 
 
153 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  31.58 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2617  protein of unknown function DUF1130  30.88 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.727406  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  26.67 
 
 
351 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  31.29 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  31.62 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4255  hypothetical protein  29.01 
 
 
178 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4341  hypothetical protein  29.01 
 
 
178 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.127657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4634  hypothetical protein  29.01 
 
 
178 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  29.69 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3400  hypothetical protein  28.22 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000709741  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  32.56 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  30.22 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  28.15 
 
 
167 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  25.71 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  27.41 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  29.5 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  29.45 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4240  hypothetical protein  27.41 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0072533  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  28.47 
 
 
171 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  27.94 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  25.5 
 
 
297 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1898  hypothetical protein  30.53 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0934802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>